More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1936 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  100 
 
 
309 aa  612  1e-174  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  99.35 
 
 
309 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  45.02 
 
 
312 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.11 
 
 
316 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.56 
 
 
311 aa  235  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.46 
 
 
311 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1439  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.18 
 
 
325 aa  221  1e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.93 
 
 
314 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.7 
 
 
319 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.84 
 
 
314 aa  214  1e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.52 
 
 
313 aa  214  2e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.67 
 
 
308 aa  214  2e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.86 
 
 
306 aa  213  4e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.2 
 
 
314 aa  212  8e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0405  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.07 
 
 
321 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0771375  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.74 
 
 
321 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  7.35935e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.59 
 
 
314 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.31 
 
 
311 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.45 
 
 
310 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.59125e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1055  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.43008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.14 
 
 
321 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.76676e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.68 
 
 
314 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3568  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.67 
 
 
323 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000147848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3550  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.67 
 
 
323 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3946  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.67 
 
 
323 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3820  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.67 
 
 
323 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3660  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.67 
 
 
323 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00940853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.44 
 
 
311 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.54 
 
 
338 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.41 
 
 
311 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  35.45 
 
 
309 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.27 
 
 
311 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3847  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.33 
 
 
323 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3856  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.33 
 
 
323 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.61391e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.46 
 
 
322 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.71 
 
 
311 aa  202  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3907  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.99 
 
 
323 aa  201  1e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.4 
 
 
311 aa  201  1e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  37.2 
 
 
307 aa  201  1e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.71 
 
 
311 aa  201  2e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.29832e-06  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0370  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.3 
 
 
321 aa  201  2e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.125476  normal  0.302876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.71 
 
 
311 aa  201  2e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1337  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.99 
 
 
323 aa  201  2e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.536973  hitchhiker  0.00905028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1416  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.98 
 
 
299 aa  201  2e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  36.36 
 
 
311 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.06 
 
 
308 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
311 aa  199  4e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
311 aa  199  4e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.74 
 
 
311 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.25 
 
 
308 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3272  bifunctional riboflavin kinase and FMN adenylyltransferase  37.07 
 
 
310 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.71 
 
 
309 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.88 
 
 
306 aa  198  8e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0023  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  198  8e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.38833e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3574  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.79 
 
 
313 aa  197  1e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.15482e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0027  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  197  1e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.89378e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.47 
 
 
308 aa  198  1e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.8 
 
 
330 aa  198  1e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0029  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  197  1e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.42889e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  34.27 
 
 
322 aa  197  1e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0025  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  197  1e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.98514e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0027  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  197  1e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.78578e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
311 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.45 
 
 
311 aa  197  2e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
311 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.3 
 
 
311 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3630  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000550981  normal  0.819569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00029  putative regulator  35.79 
 
 
313 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.73781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00028  hypothetical protein  35.79 
 
 
313 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  9.26876e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3631  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.64 
 
 
323 aa  196  4e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.11 
 
 
309 aa  196  4e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.4 
 
 
311 aa  196  4e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.92 
 
 
311 aa  196  4e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.37633e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.05 
 
 
310 aa  196  5e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.49 
 
 
312 aa  196  5e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.07 
 
 
289 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.8 
 
 
317 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.89 
 
 
328 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0613  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.74 
 
 
319 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.21 
 
 
311 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.0021e-06  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2123  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.07 
 
 
322 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2079  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.07 
 
 
322 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.82 
 
 
311 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2461  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.22 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.012862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.14 
 
 
318 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.31825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.71 
 
 
320 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.97835e-07  hitchhiker  1.24783e-05 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.9 
 
 
312 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.3 
 
 
316 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  40.97 
 
 
309 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.93 
 
 
312 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1124  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.78 
 
 
315 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.97 
 
 
312 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.42 
 
 
315 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  37.33 
 
 
320 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00012  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.68 
 
 
320 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000105637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60380  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.33 
 
 
312 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.78317e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2653  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.43 
 
 
335 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0363  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
309 aa  190  3e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.94086e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.04 
 
 
314 aa  190  3e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1061  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
317 aa  190  3e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>