More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1867 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  90.45 
 
 
431 aa  747  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  100 
 
 
441 aa  884  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  39.78 
 
 
399 aa  302  8e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.78 
 
 
399 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  34.29 
 
 
400 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  30.57 
 
 
377 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  28.92 
 
 
377 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  29.61 
 
 
379 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  29.65 
 
 
376 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  28.09 
 
 
379 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  30.03 
 
 
404 aa  181  3e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  26.23 
 
 
402 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  28.72 
 
 
411 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  27.88 
 
 
379 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  28.21 
 
 
432 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  29.68 
 
 
375 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  54.92 
 
 
375 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  29.91 
 
 
375 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  26.76 
 
 
404 aa  154  3e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  27.19 
 
 
448 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  24.15 
 
 
374 aa  152  9e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  25.19 
 
 
372 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  43.75 
 
 
282 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  27.92 
 
 
374 aa  148  2e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  29.59 
 
 
469 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  31.13 
 
 
373 aa  142  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  47.45 
 
 
324 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  53.28 
 
 
524 aa  136  7e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  51.22 
 
 
309 aa  134  2e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.49073e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  27.36 
 
 
419 aa  134  4e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  48.41 
 
 
482 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  50.39 
 
 
430 aa  133  7e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.69 
 
 
274 aa  133  8e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.10987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  54.95 
 
 
490 aa  132  1e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  51.24 
 
 
651 aa  130  4e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.72 
 
 
430 aa  129  7e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  35.51 
 
 
302 aa  129  8e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  27.37 
 
 
414 aa  129  1e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.91008e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  59 
 
 
414 aa  129  1e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  47.58 
 
 
398 aa  129  1e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  53.85 
 
 
415 aa  129  1e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.11 
 
 
445 aa  128  2e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.82 
 
 
751 aa  128  2e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6694e-14 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  32.41 
 
 
300 aa  128  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  56.14 
 
 
328 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  48.7 
 
 
665 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  50.4 
 
 
538 aa  127  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  48.12 
 
 
527 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.25 
 
 
301 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  55.17 
 
 
216 aa  126  8e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  54.46 
 
 
238 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  48.8 
 
 
417 aa  126  9e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.12 
 
 
452 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.78681e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  51.35 
 
 
472 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  40.46 
 
 
448 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  50 
 
 
676 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  50.89 
 
 
455 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  26.77 
 
 
474 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.08 
 
 
314 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  32.34 
 
 
442 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  47.93 
 
 
651 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  7.63008e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  44.05 
 
 
656 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  44.9 
 
 
429 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  47.41 
 
 
695 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  51.64 
 
 
648 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  47.93 
 
 
651 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  51.79 
 
 
456 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  31.84 
 
 
459 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  32.19 
 
 
367 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  52.68 
 
 
523 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42 
 
 
321 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  47.93 
 
 
301 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  44.44 
 
 
300 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  49.11 
 
 
680 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  35 
 
 
341 aa  124  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  52.25 
 
 
697 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  52.25 
 
 
697 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  49.58 
 
 
414 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  33.59 
 
 
300 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  50.89 
 
 
692 aa  124  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  53.51 
 
 
394 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  51.56 
 
 
529 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  48.21 
 
 
681 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  50.43 
 
 
676 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  47.58 
 
 
271 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  49.18 
 
 
423 aa  123  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  47.29 
 
 
727 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  51.35 
 
 
699 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  51.35 
 
 
681 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  47.29 
 
 
727 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  5.39525e-05  unclonable  8.07187e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  25.22 
 
 
421 aa  122  1e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.96043e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.91 
 
 
287 aa  122  1e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  50 
 
 
287 aa  122  1e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  50.88 
 
 
440 aa  121  2e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  43.59 
 
 
265 aa  122  2e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  44.26 
 
 
363 aa  121  2e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  24.89 
 
 
424 aa  121  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.35417e-07  hitchhiker  5.37806e-12 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.57 
 
 
443 aa  121  2e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  50.88 
 
 
440 aa  121  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  42.96 
 
 
646 aa  122  2e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>