145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1842 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  500  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  97.66 
 
 		 256 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  42.19 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  41.8 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  39.52 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  40.08 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  38.46 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  33.98 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  35.9 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  33.74 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  36.55 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  36.17 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  34.27 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  34.27 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  32.5 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  36.36 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  32.92 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  32.22 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  31.3 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  31.74 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  31.74 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  28.06 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  25.91 
 
 		 467 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  26.56 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  27.62 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  29.67 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  24.89 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  25.1 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  26.05 
 
 		 468 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  25.4 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  24.79 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  25.31 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  24.69 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  25.76 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  25.76 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  24.8 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  25.76 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  24.9 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  25.76 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  26.97 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.79 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  21.98 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  24.19 
 
 		 510 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  26.14 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  27.42 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  24.6 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  28.21 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  24.17 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  24.15 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  25.38 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  22.82 
 
 		 529 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  25.38 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  25.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25.38 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  25.38 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  26.12 
 
 		 634 aa  69.7  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  25.5 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  22.88 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  22.88 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  23.97 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  21.81 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  21.95 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  23.36 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  25.4 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  25.4 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  25.4 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  22.88 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  22.31 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  23.77 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  24.03 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  22.69 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  25.4 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  22.9 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.97 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  30.68 
 
 		 478 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  23.24 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  25.4 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  25.62 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  24.59 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  24.12 
 
 		 411 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.45 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  21.25 
 
 		 529 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  23.93 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  21.9 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  21.9 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  21.9 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  23.83 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  22.41 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  22.45 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  24.58 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  22.91 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  26.92 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  22.31 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  22.04 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  22.08 
 
 		 555 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  23.41 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>