206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1834 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 273 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  97.44 
 
 		 273 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  54.95 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  46.86 
 
 		 278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  48.65 
 
 		 276 aa  271  7e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  50.76 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  50.76 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  45.9 
 
 		 275 aa  254  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  47.1 
 
 		 276 aa  249  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  41.39 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  48.71 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  41.11 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  42.8 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  38.89 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  41.38 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  41.92 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  40.6 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  40.23 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  40.84 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  40.6 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  40.23 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  40.23 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  39.31 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  40.61 
 
 		 266 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  26.56 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  25.94 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  35.21 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  22.96 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  29.11 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.56 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.56 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  29.25 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  26.58 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  30.64 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  30.97 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  23.08 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  34.51 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  26.95 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  35.34 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  26.47 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  27.22 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  35.51 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  30.34 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  27.22 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  24.3 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  37.25 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.92 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.4 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  28.72 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  22.56 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  25.54 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  29.37 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.1 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.17 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.2 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.17 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.67 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  29.03 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.67 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.67 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.67 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.67 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  39.56 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  26.64 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.14 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  27.95 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.03 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  28.3 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.58 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.77 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  25.43 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  22.56 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.39 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  27.81 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  27.81 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  29.85 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  24.8 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  25 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  30.67 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  26.49 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  24.72 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  32.52 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.34 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  26.02 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  23.77 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  29.66 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  22.54 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  25.1 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  23.81 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>