More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1794 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  46.86 
 
 
228 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  43.72 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  38.57 
 
 
244 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  36.28 
 
 
243 aa  148  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 
239 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  32.29 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  33.02 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  34.55 
 
 
240 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  35.48 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  38.86 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.16 
 
 
239 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  30.22 
 
 
238 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  32.59 
 
 
239 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.86 
 
 
242 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 
243 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  34.84 
 
 
242 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 
264 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  34.42 
 
 
217 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.85 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  29.65 
 
 
248 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  28.51 
 
 
249 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  29.19 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  32.13 
 
 
241 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.88 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  32.38 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  32.38 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  32.37 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  32.38 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  36.17 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  32.38 
 
 
242 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  31.9 
 
 
242 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  32.38 
 
 
242 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  31.13 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  39.13 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  36.18 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  28.44 
 
 
241 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  27.91 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  26.98 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  27.7 
 
 
245 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  27.27 
 
 
226 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  29.36 
 
 
228 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  27.44 
 
 
240 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  27.23 
 
 
474 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  28.51 
 
 
227 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  27.83 
 
 
225 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  29.09 
 
 
228 aa  105  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  27.27 
 
 
226 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  26.7 
 
 
234 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  29.38 
 
 
251 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  29.13 
 
 
225 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  29.38 
 
 
262 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  31.16 
 
 
221 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  29.47 
 
 
238 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  26.82 
 
 
227 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  30.59 
 
 
232 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  34.01 
 
 
210 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  27.36 
 
 
225 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  27.36 
 
 
225 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  27.36 
 
 
225 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  28.57 
 
 
228 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  24 
 
 
228 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  27.36 
 
 
225 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  27.36 
 
 
225 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  27.36 
 
 
225 aa  101  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  29.22 
 
 
221 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  27.52 
 
 
219 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  27.91 
 
 
227 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  28.1 
 
 
228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  27.36 
 
 
225 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  28.29 
 
 
230 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  28.1 
 
 
228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  31.67 
 
 
231 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  30.88 
 
 
221 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  30.19 
 
 
226 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  28.43 
 
 
230 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  31.58 
 
 
230 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  27.36 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  30.41 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  25.94 
 
 
235 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  30.37 
 
 
232 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  26.94 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  30.39 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  29.11 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  27.8 
 
 
230 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  27.98 
 
 
245 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  29.23 
 
 
213 aa  98.2  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  30.18 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  27.72 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  33.16 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  28.77 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  25.51 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  29.56 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  27.6 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  32.42 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  28.31 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  30.09 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  25 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>