25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1780 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1780  putative lipoprotein  100 
 
 
445 aa  899    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1508  putative lipoprotein  96.63 
 
 
445 aa  868    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0639  hypothetical protein  29.81 
 
 
463 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0150059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0627  hypothetical protein  29.57 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.665154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0200  hypothetical protein  27.54 
 
 
549 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0418162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0239  YdaL  25.96 
 
 
549 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0211882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0204  hypothetical protein  24.82 
 
 
549 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000016319  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00391  hypothetical protein  25.73 
 
 
578 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0724219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0213  hypothetical protein  24.47 
 
 
549 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0013611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0223  hypothetical protein  24.47 
 
 
549 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0200  hypothetical protein  24.47 
 
 
549 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0232  hypothetical protein  24.47 
 
 
549 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5087  hypothetical protein  24.53 
 
 
549 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224053  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3614  hypothetical protein  27.06 
 
 
572 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.746292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4691  hypothetical protein  27.06 
 
 
572 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0863049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0239  hypothetical protein  24.21 
 
 
549 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.374038  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7091  hypothetical protein  29.41 
 
 
547 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0257  hypothetical protein  24.11 
 
 
549 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0380  hypothetical protein  24.11 
 
 
547 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396423  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2624  hypothetical protein  24.89 
 
 
558 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.377848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2656  hypothetical protein  26.59 
 
 
546 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352143  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2156  hypothetical protein  26.49 
 
 
550 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2246  hypothetical protein  27.15 
 
 
541 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3172  hypothetical protein  22.63 
 
 
605 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11318  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2519  hypothetical protein  24.59 
 
 
577 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>