More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1728 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  98.32 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  41.5 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 273 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  41 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  41 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  41 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  41 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  41 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 372 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  41 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  38.76 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  35.54 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  40.4 
 
 		 273 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 		 273 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 273 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 357 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.2 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  38.19 
 
 		 275 aa  124  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  38.69 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  38.69 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  35.56 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  37.69 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 		 368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.98 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 372 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.13 
 
 		 503 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  31.91 
 
 		 332 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.65 
 
 		 1115 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  31.65 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.65 
 
 		 927 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.65 
 
 		 1115 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.65 
 
 		 1119 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.65 
 
 		 1115 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.5 
 
 		 373 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 382 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.73 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.19 
 
 		 1115 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.42 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  34.3 
 
 		 872 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.33 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  29.58 
 
 		 324 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 409 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  34.34 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.16 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.5 
 
 		 417 aa  99.8  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.36 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 242 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 324 aa  98.2  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 320 aa  97.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.47 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.38 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.66 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>