More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1721 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
643 aa  1295    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  99.07 
 
 
643 aa  1283    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  44.74 
 
 
639 aa  553  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  43.88 
 
 
666 aa  552  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  43.89 
 
 
634 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  47.02 
 
 
630 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  46.55 
 
 
638 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
640 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 
658 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 
658 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 
658 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  41.9 
 
 
644 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 
658 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
644 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 
662 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 
659 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  42.28 
 
 
659 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  40.99 
 
 
658 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
644 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
641 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  42.15 
 
 
636 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  41.55 
 
 
638 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  40.71 
 
 
639 aa  485  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
636 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  43.65 
 
 
640 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  36.96 
 
 
645 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
644 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
767 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  38.82 
 
 
642 aa  462  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  38.82 
 
 
642 aa  462  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  38.72 
 
 
635 aa  456  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.79 
 
 
643 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  39.07 
 
 
620 aa  439  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.26 
 
 
564 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.82 
 
 
668 aa  432  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  36.24 
 
 
649 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  37.6 
 
 
649 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  40.45 
 
 
581 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
627 aa  424  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  37.44 
 
 
630 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  38.04 
 
 
638 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 
643 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  41.21 
 
 
634 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.22 
 
 
575 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.12 
 
 
645 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.22 
 
 
567 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  39.01 
 
 
657 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
632 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  37.8 
 
 
690 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  40.71 
 
 
540 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
648 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  39.89 
 
 
564 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  34.95 
 
 
649 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  39.45 
 
 
574 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 
536 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
663 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
645 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 
663 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.91 
 
 
672 aa  402  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  40.68 
 
 
541 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  36.35 
 
 
636 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  35.41 
 
 
648 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  35.76 
 
 
637 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40 
 
 
709 aa  399  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
641 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  40.49 
 
 
541 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  36.62 
 
 
641 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  36.84 
 
 
642 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  39.59 
 
 
572 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.91 
 
 
632 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.19 
 
 
645 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  37.33 
 
 
574 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.8 
 
 
685 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
572 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.16 
 
 
641 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  38.73 
 
 
569 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  35.23 
 
 
659 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  38.52 
 
 
659 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  37.92 
 
 
544 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.84 
 
 
646 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  34.55 
 
 
667 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  36.42 
 
 
650 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
545 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  34.71 
 
 
650 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  38.14 
 
 
543 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  37.41 
 
 
583 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  37.5 
 
 
543 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
540 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.48 
 
 
549 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  37.68 
 
 
540 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 
544 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  36.1 
 
 
545 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 
546 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  34.05 
 
 
651 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  36.97 
 
 
545 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  37.5 
 
 
542 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
626 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 
626 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  34.76 
 
 
667 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  36.01 
 
 
575 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>