295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1661 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  100 
 
 
192 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  100 
 
 
192 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  49.21 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  48.95 
 
 
200 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.15 
 
 
195 aa  185  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  42.02 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.36 
 
 
186 aa  134  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.46 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  32.53 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.13 
 
 
190 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.46 
 
 
194 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 
189 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.68 
 
 
189 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  29.44 
 
 
190 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
191 aa  101  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
200 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.09 
 
 
190 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.26 
 
 
192 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  33.33 
 
 
188 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.11 
 
 
190 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
189 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  29.41 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  30.38 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.32 
 
 
188 aa  94.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  28.19 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.72 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  29.45 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.81 
 
 
160 aa  90.9  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
216 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.95 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.96 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.25 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.34 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.5 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.98 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.09 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.37 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.58 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  28.32 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  27.11 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  33.09 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  26.04 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.06 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.39 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  27.27 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  32.24 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  31.62 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.67 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  26.8 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  29.45 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.32 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  28.92 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  31.62 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.02 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  28.04 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  28.38 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  32.09 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.12 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  30.99 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.67 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  33 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.12 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  33.33 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.86 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  29.41 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  26.15 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  28.07 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  26.14 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.2 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.88 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  21.89 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.09 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  32.28 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  26.58 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  25.9 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  25.41 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  27.22 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  28.67 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  23.91 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.44 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  23.04 
 
 
291 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.17 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.26 
 
 
171 aa  61.6  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
149 aa  61.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.62 
 
 
215 aa  61.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  28.83 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  22.51 
 
 
292 aa  61.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.94 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  30 
 
 
229 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  26.9 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  31.67 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.9 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>