144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1586 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
415 aa  851  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  52.87 
 
 
436 aa  441  1e-122  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  46.73 
 
 
409 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  43.23 
 
 
417 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  38.89 
 
 
413 aa  273  4e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  36.87 
 
 
413 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  32.13 
 
 
414 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  32.07 
 
 
414 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  32.23 
 
 
440 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  33.65 
 
 
421 aa  207  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  32.98 
 
 
444 aa  206  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  31.43 
 
 
420 aa  200  4e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  30.56 
 
 
417 aa  184  2e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  30.02 
 
 
413 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  30.02 
 
 
413 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  29.79 
 
 
413 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  31.22 
 
 
419 aa  179  6e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  29.86 
 
 
524 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  28.86 
 
 
423 aa  173  6e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  29.95 
 
 
426 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  27.5 
 
 
407 aa  163  4e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  30.83 
 
 
404 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  29.69 
 
 
425 aa  162  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  29.69 
 
 
425 aa  162  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  29.69 
 
 
425 aa  162  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  28.3 
 
 
434 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  29.09 
 
 
407 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  29.18 
 
 
412 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  26.45 
 
 
408 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  29.23 
 
 
445 aa  148  1e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  26.44 
 
 
384 aa  147  4e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.83 
 
 
544 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  26.05 
 
 
424 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  30.26 
 
 
390 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  26.53 
 
 
416 aa  142  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  28.86 
 
 
389 aa  139  9e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  26.6 
 
 
428 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  25.98 
 
 
444 aa  135  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  25.74 
 
 
431 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  28.46 
 
 
412 aa  133  7e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  28.46 
 
 
412 aa  133  7e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  28.03 
 
 
389 aa  133  7e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  28.03 
 
 
404 aa  132  8e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  27.53 
 
 
389 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  30.38 
 
 
415 aa  128  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.7 
 
 
416 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  25.97 
 
 
434 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  26.27 
 
 
404 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  25.33 
 
 
473 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.48 
 
 
411 aa  123  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.66 
 
 
833 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.66 
 
 
859 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.66 
 
 
833 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.14 
 
 
447 aa  119  8e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25.7 
 
 
455 aa  117  4e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  24.73 
 
 
408 aa  117  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  26.41 
 
 
397 aa  115  1e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  25.5 
 
 
432 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  25.33 
 
 
457 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  25.75 
 
 
434 aa  113  7e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  25.49 
 
 
409 aa  112  1e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.07 
 
 
455 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  24.11 
 
 
411 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  25.23 
 
 
420 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  24.15 
 
 
454 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  24.15 
 
 
454 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 
416 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 
416 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  25.94 
 
 
428 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  25.82 
 
 
417 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  23.73 
 
 
412 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.85 
 
 
391 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  28.39 
 
 
264 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.2 
 
 
441 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  22.27 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  31.73 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  25.37 
 
 
542 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  24.63 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  23.97 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  33.7 
 
 
225 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  28.18 
 
 
393 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  24 
 
 
437 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  22.07 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  25.77 
 
 
414 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  24.58 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  26.03 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  24.72 
 
 
391 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  24.37 
 
 
420 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  24.59 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  22.52 
 
 
445 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  22.52 
 
 
445 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  23.21 
 
 
399 aa  87  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  23.9 
 
 
398 aa  85.9  1e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  27.19 
 
 
399 aa  84.3  3e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  22.07 
 
 
422 aa  84  4e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  26.73 
 
 
392 aa  84  4e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  23.53 
 
 
408 aa  83.6  6e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  24.29 
 
 
429 aa  82.8  9e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  21.22 
 
 
436 aa  82.8  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  21.22 
 
 
436 aa  82.8  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>