More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1529 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  100 
 
 
300 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  98 
 
 
300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  58.88 
 
 
304 aa  361  8e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  60.4 
 
 
302 aa  350  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3063  cysteine synthase  63.16 
 
 
304 aa  332  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  53.54 
 
 
306 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  54.7 
 
 
312 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  58.03 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  54.79 
 
 
311 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  57.62 
 
 
307 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  56.58 
 
 
307 aa  311  9e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  52.67 
 
 
310 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  52.67 
 
 
310 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  54.03 
 
 
312 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  52 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  53.64 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  57.1 
 
 
305 aa  308  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  51.16 
 
 
302 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  54.67 
 
 
307 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  59.08 
 
 
306 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  52.17 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  52.68 
 
 
305 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  52.68 
 
 
305 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57 
 
 
311 aa  299  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  53.14 
 
 
305 aa  299  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.8 
 
 
308 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  50.5 
 
 
304 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  50.5 
 
 
321 aa  297  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  55.36 
 
 
291 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  52.68 
 
 
305 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  55.63 
 
 
306 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  55.36 
 
 
290 aa  296  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  53.67 
 
 
306 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  52.68 
 
 
305 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  57.28 
 
 
307 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  57.28 
 
 
307 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  57.28 
 
 
307 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  57.28 
 
 
307 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  55.96 
 
 
317 aa  296  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  57.28 
 
 
307 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  57.62 
 
 
307 aa  295  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  53.02 
 
 
306 aa  295  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  57.33 
 
 
308 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.58 
 
 
308 aa  295  8e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  57.62 
 
 
307 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  56.95 
 
 
307 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.46 
 
 
310 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  57.28 
 
 
307 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  56.67 
 
 
308 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  57.28 
 
 
307 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  53.18 
 
 
303 aa  292  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  49.66 
 
 
306 aa  291  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  53.44 
 
 
310 aa  291  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  51.34 
 
 
305 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  54.4 
 
 
310 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  54.97 
 
 
317 aa  290  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  52.79 
 
 
307 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  50.85 
 
 
307 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  52.01 
 
 
305 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  51.68 
 
 
305 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  55.23 
 
 
309 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  52.16 
 
 
307 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  53.92 
 
 
311 aa  288  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  49.66 
 
 
315 aa  288  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  52.6 
 
 
309 aa  288  8e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.96 
 
 
309 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  55.63 
 
 
321 aa  287  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  48.68 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  49.83 
 
 
308 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  50.34 
 
 
305 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.84 
 
 
306 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  50 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  53.14 
 
 
308 aa  285  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  53.27 
 
 
327 aa  285  9e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  51.34 
 
 
321 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  47.83 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  51.31 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.17 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  54.13 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  50.84 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  51.32 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  52.3 
 
 
309 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  49.34 
 
 
309 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  52.03 
 
 
305 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  51.8 
 
 
309 aa  280  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  51.97 
 
 
311 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  48.68 
 
 
309 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  51.16 
 
 
309 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.01 
 
 
306 aa  279  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  52.96 
 
 
314 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  51.82 
 
 
308 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  48.18 
 
 
309 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  46.62 
 
 
303 aa  278  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  50.98 
 
 
310 aa  278  9e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  50.5 
 
 
309 aa  277  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  49.01 
 
 
309 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  52.7 
 
 
310 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  49.84 
 
 
309 aa  276  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  52.3 
 
 
310 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  52.48 
 
 
309 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>