More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1502 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  49.15 
 
 		 709 aa  685    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  52.52 
 
 		 812 aa  753    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  47.19 
 
 		 792 aa  647    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  52.24 
 
 		 806 aa  752    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  49.44 
 
 		 706 aa  661    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  52.82 
 
 		 808 aa  754    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  52.8 
 
 		 804 aa  756    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  52.68 
 
 		 810 aa  754    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  49.93 
 
 		 716 aa  670    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  46.63 
 
 		 790 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  54.84 
 
 		 788 aa  798    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  52.8 
 
 		 814 aa  751    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  52.52 
 
 		 806 aa  751    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  52.82 
 
 		 808 aa  755    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  53.36 
 
 		 792 aa  743    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  52.82 
 
 		 808 aa  754    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  51.13 
 
 		 903 aa  693    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  54.64 
 
 		 716 aa  763    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  49.15 
 
 		 770 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  54.1 
 
 		 722 aa  729    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  49.15 
 
 		 706 aa  706    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  54.34 
 
 		 762 aa  776    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  46.63 
 
 		 790 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  54.35 
 
 		 758 aa  761    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  55.8 
 
 		 757 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  100 
 
 		 751 aa  1516    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  99.33 
 
 		 751 aa  1506    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  52.52 
 
 		 806 aa  755    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  45.31 
 
 		 705 aa  633  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  46.19 
 
 		 715 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  46.26 
 
 		 759 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  43.18 
 
 		 763 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  44.89 
 
 		 763 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  43.15 
 
 		 810 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  42.56 
 
 		 801 aa  556  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  41.21 
 
 		 722 aa  552  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  42.66 
 
 		 817 aa  550  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  41.95 
 
 		 708 aa  545  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  41.96 
 
 		 752 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  44.31 
 
 		 779 aa  542  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  43.79 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  43.79 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  41.31 
 
 		 801 aa  542  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  39.04 
 
 		 827 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  42.92 
 
 		 737 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  43.36 
 
 		 774 aa  540  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  39.51 
 
 		 720 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  42.51 
 
 		 737 aa  539  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  39.97 
 
 		 857 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  41.57 
 
 		 777 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  39.89 
 
 		 876 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  39.72 
 
 		 859 aa  529  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  40.23 
 
 		 857 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  42.94 
 
 		 801 aa  524  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  39.83 
 
 		 857 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  41.19 
 
 		 726 aa  522  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  39.78 
 
 		 877 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  39.76 
 
 		 870 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  41.77 
 
 		 766 aa  518  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  38.95 
 
 		 937 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  39.64 
 
 		 877 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  39.39 
 
 		 818 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  39.6 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  40.67 
 
 		 755 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  38.55 
 
 		 803 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  38.64 
 
 		 906 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  38.06 
 
 		 828 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  38.64 
 
 		 907 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  39.15 
 
 		 735 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  39.12 
 
 		 840 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  41.33 
 
 		 737 aa  508  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  39.32 
 
 		 864 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  37.96 
 
 		 861 aa  505  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  40.06 
 
 		 876 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  38.11 
 
 		 895 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  37.98 
 
 		 886 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  38.94 
 
 		 871 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  37.98 
 
 		 896 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  37.98 
 
 		 812 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  37.98 
 
 		 896 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  37.98 
 
 		 838 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  37.98 
 
 		 838 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  37.98 
 
 		 838 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  38.96 
 
 		 758 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  39.37 
 
 		 848 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  38.25 
 
 		 828 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  38.66 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  38.52 
 
 		 817 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  38.26 
 
 		 746 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  38.66 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  38.26 
 
 		 746 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  38.8 
 
 		 817 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  38.66 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  38.8 
 
 		 817 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  38.44 
 
 		 834 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  40.06 
 
 		 805 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  38.83 
 
 		 758 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  39.06 
 
 		 749 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  39.2 
 
 		 736 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  38.01 
 
 		 833 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>