298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1498 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  377  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  377  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  63.02 
 
 
190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  63.02 
 
 
190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  56.7 
 
 
194 aa  214  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 
190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
190 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  46.35 
 
 
206 aa  180  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
196 aa  174  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
193 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
197 aa  170  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
190 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
190 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
197 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 
192 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
191 aa  167  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
190 aa  167  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  42.78 
 
 
193 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
190 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
190 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 
192 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
192 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
192 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 
188 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
195 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  161  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
197 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
197 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
189 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  47.64 
 
 
189 aa  154  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
192 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
193 aa  151  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
192 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
200 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
202 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  32.98 
 
 
798 aa  109  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  30.12 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  27.39 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  26.95 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  26.95 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  29.03 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  30.67 
 
 
271 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  28.23 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  25.85 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  28.23 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  28.23 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  28.23 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  28.23 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  28.23 
 
 
282 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  28.23 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  21.88 
 
 
278 aa  58.9  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  23.46 
 
 
274 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  25.64 
 
 
274 aa  58.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  22.35 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  28.83 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  25 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  30.16 
 
 
272 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  25.26 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
157 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  23.75 
 
 
274 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  25.26 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  22.78 
 
 
271 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>