More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1463 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  100 
 
 
468 aa  937    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  98.93 
 
 
468 aa  927    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  69.82 
 
 
459 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  65.28 
 
 
761 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  62.63 
 
 
464 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  61.8 
 
 
464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  61.39 
 
 
466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  59.65 
 
 
455 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  58.91 
 
 
469 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  59.51 
 
 
469 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  59.56 
 
 
468 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.24 
 
 
457 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.96 
 
 
469 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.98 
 
 
497 aa  529  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  56.03 
 
 
482 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  56.93 
 
 
483 aa  521  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  58.82 
 
 
470 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  56.42 
 
 
476 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  56.49 
 
 
477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.82 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  60 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  56.8 
 
 
463 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.86 
 
 
466 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.24 
 
 
474 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  56.75 
 
 
468 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  55.24 
 
 
480 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  55.96 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  55.03 
 
 
482 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  55.51 
 
 
480 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.01 
 
 
479 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.05 
 
 
458 aa  498  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.05 
 
 
469 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54 
 
 
464 aa  491  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.39 
 
 
467 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.63 
 
 
461 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.43 
 
 
465 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  52.79 
 
 
465 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  53.78 
 
 
470 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  53.78 
 
 
476 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  54.66 
 
 
471 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  53.43 
 
 
465 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  53.58 
 
 
476 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  54.66 
 
 
469 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  54.09 
 
 
476 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  52.42 
 
 
503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.23 
 
 
466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  53.98 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.08 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  52.36 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.89 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  52.72 
 
 
469 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.9 
 
 
448 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  52.72 
 
 
469 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.75 
 
 
1005 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  54.22 
 
 
446 aa  458  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50 
 
 
994 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.68 
 
 
467 aa  457  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  54.84 
 
 
747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.36 
 
 
447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.19 
 
 
465 aa  450  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.79 
 
 
1008 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.79 
 
 
1011 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.57 
 
 
1011 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.86 
 
 
994 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  52.43 
 
 
473 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  51.17 
 
 
473 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  47.54 
 
 
477 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.48 
 
 
447 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  45.34 
 
 
465 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.95 
 
 
483 aa  356  5.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.55 
 
 
438 aa  351  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  42.89 
 
 
947 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  46.56 
 
 
944 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  43.08 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  46.08 
 
 
942 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  46.27 
 
 
944 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  45.45 
 
 
944 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  43.15 
 
 
462 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.33 
 
 
663 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.24 
 
 
699 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.86 
 
 
658 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  40 
 
 
411 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.86 
 
 
653 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.64 
 
 
653 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.13 
 
 
555 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.64 
 
 
653 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.47 
 
 
659 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.64 
 
 
653 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.25 
 
 
659 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  40.42 
 
 
413 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.62 
 
 
1126 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  37.25 
 
 
659 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  37.25 
 
 
659 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.25 
 
 
659 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.25 
 
 
659 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  40.65 
 
 
413 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  37.25 
 
 
659 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.42 
 
 
653 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  37.47 
 
 
472 aa  289  9e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.25 
 
 
659 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>