154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1456 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  100 
 
 
851 aa  1694  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  97.88 
 
 
851 aa  1667  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.91 
 
 
861 aa  446  1e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88659e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  31.91 
 
 
861 aa  448  1e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  31.91 
 
 
861 aa  446  1e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  31.78 
 
 
861 aa  446  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.86 
 
 
859 aa  445  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41179e-10 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.99 
 
 
859 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.66 
 
 
861 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  31.78 
 
 
861 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  31.91 
 
 
861 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  31.66 
 
 
861 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  30.9 
 
 
861 aa  418  1e-115  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  31.86 
 
 
858 aa  419  1e-115  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  30.9 
 
 
851 aa  407  1e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  30.99 
 
 
847 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  30.87 
 
 
844 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  29.82 
 
 
840 aa  372  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  58.33 
 
 
322 aa  347  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  58.31 
 
 
307 aa  326  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.61457e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  36.94 
 
 
569 aa  323  1e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  30.43 
 
 
813 aa  289  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  27.8 
 
 
863 aa  277  7e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  28.78 
 
 
850 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  40.67 
 
 
395 aa  275  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  27.57 
 
 
863 aa  274  6e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  28.76 
 
 
850 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.74946e-06 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  41.12 
 
 
840 aa  270  6e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  41.12 
 
 
840 aa  270  6e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  28.54 
 
 
850 aa  268  3e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  28.53 
 
 
867 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  26.66 
 
 
870 aa  255  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  33.87 
 
 
590 aa  254  4e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  28.17 
 
 
854 aa  253  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.22 
 
 
872 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  28.21 
 
 
867 aa  248  5e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  27.45 
 
 
881 aa  247  7e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  27.54 
 
 
877 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  27.54 
 
 
877 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  29.22 
 
 
850 aa  243  8e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  29.01 
 
 
850 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  29.34 
 
 
850 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  29.34 
 
 
850 aa  243  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  25.22 
 
 
875 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  29.51 
 
 
880 aa  242  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  29.07 
 
 
872 aa  241  3e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  28.69 
 
 
883 aa  239  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  29.47 
 
 
869 aa  239  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  29.13 
 
 
880 aa  239  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  27.78 
 
 
879 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  27.21 
 
 
871 aa  237  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  27.21 
 
 
871 aa  237  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  27.2 
 
 
855 aa  235  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  26.57 
 
 
864 aa  234  4e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  25.12 
 
 
854 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  27.39 
 
 
850 aa  227  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  25.88 
 
 
844 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  27.67 
 
 
880 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  27.58 
 
 
880 aa  223  1e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  24.69 
 
 
864 aa  223  1e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  26.26 
 
 
877 aa  222  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  25.72 
 
 
844 aa  221  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  27.39 
 
 
864 aa  218  3e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  26.99 
 
 
880 aa  217  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  28.28 
 
 
556 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  28.28 
 
 
556 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  26.86 
 
 
866 aa  211  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  25.46 
 
 
864 aa  210  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  25.09 
 
 
889 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  25.09 
 
 
889 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  24.67 
 
 
864 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  29.66 
 
 
556 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  24.91 
 
 
880 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  24.97 
 
 
889 aa  207  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  26.49 
 
 
880 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  26.48 
 
 
880 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  25.76 
 
 
862 aa  199  1e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  24.29 
 
 
850 aa  198  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  28.05 
 
 
876 aa  198  4e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  24.64 
 
 
864 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  33.44 
 
 
896 aa  192  3e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  28.04 
 
 
881 aa  191  3e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  24.39 
 
 
864 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  35.56 
 
 
346 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  26.93 
 
 
881 aa  189  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  24.5 
 
 
861 aa  184  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  32.23 
 
 
429 aa  184  8e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  26.03 
 
 
557 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  28.74 
 
 
568 aa  167  1e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  24.02 
 
 
875 aa  163  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  23.03 
 
 
739 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  23.01 
 
 
839 aa  111  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  20.96 
 
 
850 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  24.5 
 
 
592 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  21.68 
 
 
723 aa  105  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  21.73 
 
 
1132 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  23.53 
 
 
844 aa  101  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  22.98 
 
 
346 aa  99.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  25.7 
 
 
917 aa  98.2  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  23.76 
 
 
1118 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>