141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1413 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  100 
 
 
538 aa  1058  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  98.7 
 
 
538 aa  1046  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  39.21 
 
 
535 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.8595e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  30.44 
 
 
539 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  28.79 
 
 
544 aa  208  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  29.94 
 
 
510 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  30.38 
 
 
510 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  30.7 
 
 
517 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 
534 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
515 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
535 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  29.12 
 
 
513 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 
526 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 
522 aa  154  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  22.61 
 
 
512 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  25.9 
 
 
544 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  25.86 
 
 
544 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  25.9 
 
 
544 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
544 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  26.18 
 
 
544 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  25.69 
 
 
544 aa  142  1e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  25.7 
 
 
544 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  25.48 
 
 
544 aa  141  4e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 
544 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 
542 aa  136  1e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  25 
 
 
516 aa  135  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1338  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
514 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 
506 aa  133  1e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 
564 aa  129  1e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0529  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
518 aa  129  1e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  24.42 
 
 
520 aa  129  1e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  25.79 
 
 
529 aa  129  2e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  25.05 
 
 
506 aa  126  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  2.48278e-11 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  24.84 
 
 
506 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
519 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0050  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 
533 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
550 aa  123  1e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
459 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
529 aa  119  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  23.16 
 
 
550 aa  119  2e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  23.16 
 
 
550 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  23.88 
 
 
550 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  24.51 
 
 
550 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  25.53 
 
 
459 aa  116  8e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 
459 aa  117  8e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  26.77 
 
 
533 aa  116  8e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  24.3 
 
 
550 aa  115  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.3 
 
 
550 aa  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  24.3 
 
 
550 aa  115  1e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  25.53 
 
 
459 aa  116  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  23.56 
 
 
519 aa  116  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.3 
 
 
550 aa  116  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  24.3 
 
 
550 aa  115  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
550 aa  116  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  25.74 
 
 
459 aa  115  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  25.74 
 
 
459 aa  115  2e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  25.74 
 
 
459 aa  115  2e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
506 aa  115  2e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  25.53 
 
 
459 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  23.38 
 
 
519 aa  114  4e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  24.57 
 
 
459 aa  114  4e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  24.57 
 
 
459 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  25.11 
 
 
459 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  24.42 
 
 
506 aa  113  7e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  24.53 
 
 
506 aa  113  8e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  24.53 
 
 
506 aa  112  1e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  23.37 
 
 
519 aa  112  1e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  113  1e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4659e-06 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  113  1e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  24.53 
 
 
506 aa  112  1e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  113  1e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  23.9 
 
 
506 aa  112  1e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.39702e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  23.37 
 
 
519 aa  112  1e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  26.48 
 
 
533 aa  112  2e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
553 aa  112  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
553 aa  112  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  23.17 
 
 
519 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  25.68 
 
 
517 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  23.17 
 
 
519 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 
541 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  25.56 
 
 
520 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  23.56 
 
 
519 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
506 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  26.28 
 
 
533 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0061  polysaccharide synthase family protein  27.94 
 
 
533 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0053  stage V sporulation protein B, putative  26.28 
 
 
533 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0054  stage V sporulation protein B  26.09 
 
 
533 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0054  stage V sporulation protein B  26.09 
 
 
533 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  22.63 
 
 
552 aa  106  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.46874e-05  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  25.91 
 
 
533 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
517 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0064  polysaccharide synthase family protein  26.28 
 
 
533 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  24.4 
 
 
522 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1390  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.83 
 
 
544 aa  103  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.106495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 
514 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1619  stage V sporulation protein B  22.37 
 
 
509 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00148254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1900  stage V sporulation protein B  22.37 
 
 
509 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.10979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  23.35 
 
 
554 aa  102  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1293  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
549 aa  100  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.619814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1313  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 
553 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.221909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>