More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1323 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  94.81 
 
 		 154 aa  286  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  56.85 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  44.2 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  46.92 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  30.37 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.63 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  22.7 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.81 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  22.06 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>