More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1297 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  100 
 
 
343 aa  668    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  96.5 
 
 
343 aa  654    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  48.79 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  44.85 
 
 
350 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  43.07 
 
 
344 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.37 
 
 
337 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.84 
 
 
363 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.46 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  41.81 
 
 
354 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  39.8 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.43 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0534  transport system permease protein  38.49 
 
 
334 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.31 
 
 
367 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  36.26 
 
 
355 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.9 
 
 
347 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.78 
 
 
334 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.78 
 
 
334 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  39.45 
 
 
367 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.5 
 
 
330 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.04 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.32 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  36.47 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.28 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  36.09 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
366 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36 
 
 
330 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  39.02 
 
 
334 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  39.02 
 
 
334 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  37.06 
 
 
354 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
359 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  39.02 
 
 
334 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  34.57 
 
 
345 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  33.43 
 
 
361 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  36.62 
 
 
356 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  33.71 
 
 
353 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  34.1 
 
 
350 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  39.81 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  36.59 
 
 
345 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  37.93 
 
 
338 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  37.41 
 
 
318 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  37.76 
 
 
369 aa  188  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  37.06 
 
 
330 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  38.62 
 
 
338 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  36.86 
 
 
340 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  34.16 
 
 
333 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  36.69 
 
 
370 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.46 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.3 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  37.07 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  33.02 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  33.14 
 
 
355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.39 
 
 
334 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.6 
 
 
368 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 
343 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.95 
 
 
350 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  35.04 
 
 
366 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  33.94 
 
 
353 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  34.3 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  34.77 
 
 
353 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  32.52 
 
 
340 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  38.52 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.94 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  35.09 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  37.25 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  33.98 
 
 
337 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  32.53 
 
 
336 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  33.03 
 
 
336 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  36.14 
 
 
357 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  37.22 
 
 
343 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  37.37 
 
 
357 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
347 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  38.06 
 
 
356 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  36.09 
 
 
357 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  33.53 
 
 
350 aa  176  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  31.71 
 
 
362 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  36.96 
 
 
332 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  31.76 
 
 
361 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2311  transport system permease protein  34.97 
 
 
351 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  35.99 
 
 
387 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  34.36 
 
 
365 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.93 
 
 
348 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  33.66 
 
 
338 aa  175  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  36.06 
 
 
340 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  32.06 
 
 
372 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  34.56 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  39.66 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  35 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  32.54 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  37.21 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.86 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  33.74 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  33.44 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  37.33 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  32.92 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.14 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  35.76 
 
 
341 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  33.14 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
343 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  34.11 
 
 
381 aa  172  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>