183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1236 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  100 
 
 
170 aa  349  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  97.65 
 
 
170 aa  342  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  52.07 
 
 
171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  47.02 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  50.89 
 
 
172 aa  174  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  46.75 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  46.43 
 
 
168 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  49.11 
 
 
172 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  48.52 
 
 
172 aa  168  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  48.5 
 
 
173 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  50.6 
 
 
171 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  47.06 
 
 
171 aa  164  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  51.2 
 
 
168 aa  164  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  51.2 
 
 
168 aa  164  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  50.6 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  51.2 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  47.2 
 
 
163 aa  162  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  50 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  47.2 
 
 
162 aa  161  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  47.2 
 
 
163 aa  159  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  49.7 
 
 
168 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  50.6 
 
 
169 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  43.35 
 
 
175 aa  157  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  43.71 
 
 
175 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  45.03 
 
 
175 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  46.88 
 
 
163 aa  154  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  49.7 
 
 
186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  46.3 
 
 
166 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  45.91 
 
 
167 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  45.51 
 
 
174 aa  151  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  47.83 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.85 
 
 
169 aa  149  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  43.98 
 
 
173 aa  148  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  43.11 
 
 
172 aa  147  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  46.15 
 
 
477 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  42.24 
 
 
162 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  44.72 
 
 
161 aa  143  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  41.21 
 
 
171 aa  142  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  41.76 
 
 
177 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  46.99 
 
 
164 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  40.61 
 
 
168 aa  141  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  46.15 
 
 
171 aa  141  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  41.51 
 
 
167 aa  140  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  45.22 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  40.36 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  45.34 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  40.74 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  44.72 
 
 
164 aa  136  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  42.94 
 
 
163 aa  134  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  38.55 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  43.9 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  40.88 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  44.79 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  44.79 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  42.77 
 
 
171 aa  131  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  42.51 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  40.25 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  40.88 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  37.14 
 
 
175 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  38.99 
 
 
175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  41.61 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  40.25 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  40.25 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  40.25 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  40.25 
 
 
178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 
178 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 
178 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  40.25 
 
 
178 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  42.41 
 
 
172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  38.36 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  37.74 
 
 
174 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  38.36 
 
 
175 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  44.17 
 
 
166 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  37.74 
 
 
175 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  39.52 
 
 
170 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  45.34 
 
 
164 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  37.5 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  34.52 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  34.52 
 
 
168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  39.75 
 
 
171 aa  117  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  35.54 
 
 
172 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  36.36 
 
 
166 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  40 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  35.85 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  35.71 
 
 
175 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  35.62 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  35.62 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  35.62 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  37.82 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  37.04 
 
 
165 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>