220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1235 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  53.57 
 
 		 666 aa  691    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  55.2 
 
 		 650 aa  724    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  47.29 
 
 		 648 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  47.73 
 
 		 650 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  49.32 
 
 		 661 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  51.59 
 
 		 760 aa  711    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  100 
 
 		 665 aa  1334    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  98.02 
 
 		 657 aa  1293    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  53.75 
 
 		 673 aa  721    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  52.63 
 
 		 671 aa  693    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  54.45 
 
 		 682 aa  724    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  48.57 
 
 		 646 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  48.95 
 
 		 650 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  49.77 
 
 		 655 aa  625  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  44.55 
 
 		 834 aa  621  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  47.59 
 
 		 677 aa  615  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  45.81 
 
 		 657 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  44.16 
 
 		 877 aa  590  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  44.44 
 
 		 655 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  44.33 
 
 		 651 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  47.21 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  40.53 
 
 		 633 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  39.85 
 
 		 637 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  40.33 
 
 		 633 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  41.93 
 
 		 647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  38.82 
 
 		 633 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  37.48 
 
 		 643 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  37.82 
 
 		 651 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  40.98 
 
 		 622 aa  327  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  37.61 
 
 		 622 aa  326  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  37.39 
 
 		 651 aa  324  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  41.56 
 
 		 627 aa  323  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  37.05 
 
 		 637 aa  323  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  39.54 
 
 		 634 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  37.94 
 
 		 621 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  39.08 
 
 		 651 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  40.66 
 
 		 631 aa  321  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  38.12 
 
 		 620 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  40.62 
 
 		 625 aa  320  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  35.64 
 
 		 632 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  40.3 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  38.05 
 
 		 620 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  37.65 
 
 		 630 aa  318  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  37.53 
 
 		 632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  39.14 
 
 		 622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  39.14 
 
 		 622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  39.96 
 
 		 622 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  39.35 
 
 		 622 aa  313  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  41.11 
 
 		 622 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  40.76 
 
 		 626 aa  313  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  37.2 
 
 		 620 aa  313  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  40.22 
 
 		 624 aa  312  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  40.27 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  38.12 
 
 		 620 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  37.48 
 
 		 636 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  39.23 
 
 		 680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  35.78 
 
 		 631 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  35.82 
 
 		 660 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  36.24 
 
 		 637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  34.53 
 
 		 625 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  39.79 
 
 		 611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  35.36 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  35.65 
 
 		 660 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  35.36 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  35.36 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  35.36 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  35.36 
 
 		 630 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  39.53 
 
 		 622 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  37.43 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  38.78 
 
 		 622 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  35.9 
 
 		 636 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  37.18 
 
 		 634 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  33.69 
 
 		 632 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  34.07 
 
 		 664 aa  300  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  37.21 
 
 		 642 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  39.35 
 
 		 628 aa  300  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  35.24 
 
 		 631 aa  300  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  38.34 
 
 		 622 aa  299  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  34.05 
 
 		 634 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  34.13 
 
 		 620 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  37.53 
 
 		 642 aa  298  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  37.79 
 
 		 639 aa  298  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  39.35 
 
 		 622 aa  298  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  37.82 
 
 		 637 aa  298  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  33.27 
 
 		 630 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  36.21 
 
 		 632 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  33.88 
 
 		 634 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  33.39 
 
 		 637 aa  296  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  38.5 
 
 		 637 aa  296  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  34.3 
 
 		 634 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  34.07 
 
 		 637 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  38.51 
 
 		 670 aa  296  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  35.25 
 
 		 622 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  33.02 
 
 		 637 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  37.23 
 
 		 628 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  34.24 
 
 		 637 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  36.56 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  32.68 
 
 		 633 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0989  K potassium transporter  39.82 
 
 		 663 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00318249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  37.61 
 
 		 622 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>