63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1226 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1261    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0446  hypothetical protein  27.1 
 
 
606 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0398916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0456  hypothetical protein  25.93 
 
 
606 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000703218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1877  hypothetical protein  23.77 
 
 
641 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.044001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  21.81 
 
 
640 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0763  hypothetical protein  22.11 
 
 
667 aa  64.3  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  22.18 
 
 
620 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  32.09 
 
 
345 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  30.6 
 
 
345 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.87 
 
 
740 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.28 
 
 
746 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.65 
 
 
699 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  21.22 
 
 
724 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  25.71 
 
 
655 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  22.5 
 
 
717 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.96 
 
 
746 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  26.44 
 
 
625 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  22.92 
 
 
717 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  19.74 
 
 
700 aa  51.2  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.54 
 
 
651 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.54 
 
 
651 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  24.45 
 
 
725 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.11 
 
 
708 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  29.41 
 
 
740 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  24.01 
 
 
708 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  22.41 
 
 
734 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  23.44 
 
 
355 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  24.07 
 
 
720 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  24.38 
 
 
720 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  24.07 
 
 
720 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  24.07 
 
 
717 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  24.82 
 
 
770 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  24.07 
 
 
720 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  24.07 
 
 
720 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  24.07 
 
 
720 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  24.07 
 
 
717 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  24.07 
 
 
720 aa  48.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.38 
 
 
764 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.38 
 
 
764 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.38 
 
 
764 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  19.5 
 
 
388 aa  47.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  21.83 
 
 
650 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  24.52 
 
 
790 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1595  hypothetical protein  22.45 
 
 
302 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00569706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  22.63 
 
 
721 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25 
 
 
730 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.47 
 
 
738 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.08 
 
 
763 aa  44.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  22.69 
 
 
712 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.68 
 
 
653 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  25.13 
 
 
357 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  22.08 
 
 
883 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  25.13 
 
 
357 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  20.93 
 
 
721 aa  44.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  31.4 
 
 
659 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  22.69 
 
 
712 aa  44.3  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  22.69 
 
 
712 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  23.94 
 
 
720 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.43 
 
 
763 aa  44.3  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.47 
 
 
738 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.08 
 
 
763 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.08 
 
 
763 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.78 
 
 
851 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>