More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1195 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1195  sensor histidine kinase  100 
 
 		 301 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000111756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1023  sensor histidine kinase  98.67 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0168106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0361  histidine kinase  35.62 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1158  histidine kinase  32.76 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3232  histidine kinase  32.75 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2292  histidine kinase  30 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.924243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 444 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2321  histidine kinase  31.37 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4282  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4646  sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4661  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  35.31 
 
 		 481 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4662  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3946  histidine kinase  31.42 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4364  histidine kinase  31.03 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0591  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4432  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4776  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4649  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  38.05 
 
 		 502 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4271  sensor histidine kinase  30.65 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.565244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  32.76 
 
 		 501 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  29.15 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 637 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 599 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 463 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  30.93 
 
 		 370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 469 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.72 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  33 
 
 		 501 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 463 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.37 
 
 		 456 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 457 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 462 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 504 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  26.4 
 
 		 447 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  33.47 
 
 		 502 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 815 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 463 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 596 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  25.61 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  25.61 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 468 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  25.61 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0685  histidine kinase  25.2 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 590 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 407 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  31.85 
 
 		 486 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 385 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 385 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  30.56 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  27.15 
 
 		 669 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 508 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 701 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 590 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 582 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  27.65 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  30 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  26.22 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  29.19 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  29.96 
 
 		 484 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  30.4 
 
 		 458 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 695 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 590 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 458 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 844 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 608 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  31.65 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 718 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 785 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>