More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1188 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  100 
 
 		 329 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  28.09 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  32.25 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  28.62 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  28.3 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  28.62 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  28.3 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  28.3 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  28.3 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  28.3 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  29.39 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  30.88 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  30.47 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  30.7 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  27.91 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  29.18 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  31.67 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  29.03 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  26.75 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  26.75 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  27.92 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  28.15 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  27.07 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  28.94 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  27 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  29 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  27 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  27.91 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  26.37 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  29.41 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  25.95 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  24.91 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  24.6 
 
 		 638 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  26.4 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 277 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  24 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  23.92 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  23.92 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  23.99 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  23.76 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  24.16 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  22.77 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.21 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  20.75 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  20.75 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  26.83 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  25.47 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  22.18 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  20.21 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  22.76 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  22.05 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  25.09 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  25.09 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  21.8 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  24.72 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>