128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1117 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  47.92 
 
 
780 aa  716  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
780 aa  1603  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  44.39 
 
 
778 aa  655  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  5.28962e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  43.71 
 
 
781 aa  647  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  39.21 
 
 
790 aa  583  1e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  39.34 
 
 
790 aa  582  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  39.05 
 
 
795 aa  564  1e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  39.18 
 
 
795 aa  565  1e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  38 
 
 
795 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  36.31 
 
 
843 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  36.03 
 
 
825 aa  535  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  35.71 
 
 
834 aa  531  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  36.22 
 
 
807 aa  518  1e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  36.11 
 
 
789 aa  517  1e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  35.89 
 
 
848 aa  512  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  35.57 
 
 
824 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  36.13 
 
 
788 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  35.18 
 
 
858 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  36.28 
 
 
778 aa  494  1e-138  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35 
 
 
786 aa  492  1e-138  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  34.49 
 
 
784 aa  492  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.81 
 
 
786 aa  485  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  35.37 
 
 
789 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.77 
 
 
810 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 
804 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.95 
 
 
787 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  34.53 
 
 
791 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  34.65 
 
 
794 aa  475  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  33.8 
 
 
791 aa  472  1e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  33.07 
 
 
800 aa  470  1e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  34.65 
 
 
784 aa  468  1e-130  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  34.02 
 
 
790 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  33.86 
 
 
767 aa  447  1e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  31.21 
 
 
780 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  32.9 
 
 
787 aa  442  1e-122  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  32.9 
 
 
787 aa  442  1e-122  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 
787 aa  442  1e-122  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  34.27 
 
 
774 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  32.77 
 
 
786 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  32.99 
 
 
786 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  32.15 
 
 
986 aa  417  1e-115  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.39 
 
 
778 aa  417  1e-115  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  34.31 
 
 
775 aa  416  1e-115  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  32.16 
 
 
781 aa  416  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.91 
 
 
777 aa  405  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  33.38 
 
 
771 aa  402  1e-110  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  33.51 
 
 
768 aa  398  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  35.37 
 
 
710 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  30.67 
 
 
805 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  33.12 
 
 
780 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  33.08 
 
 
767 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  32.99 
 
 
755 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.24 
 
 
782 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  32.61 
 
 
765 aa  368  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  31.68 
 
 
758 aa  362  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  3.74663e-06 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  31.45 
 
 
763 aa  360  6e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  31.53 
 
 
751 aa  358  2e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 
759 aa  353  8e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  30.63 
 
 
752 aa  352  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  30.27 
 
 
789 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.92 
 
 
781 aa  350  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  30.43 
 
 
748 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  31.15 
 
 
752 aa  345  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.69 
 
 
759 aa  345  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  39.27 
 
 
750 aa  334  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.86879e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  30.17 
 
 
787 aa  331  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  30.21 
 
 
720 aa  330  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  1.28676e-06 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  30.27 
 
 
794 aa  327  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30 
 
 
965 aa  323  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  30.86 
 
 
769 aa  323  1e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.52 
 
 
757 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  29.31 
 
 
807 aa  316  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  29.48 
 
 
787 aa  315  3e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.5 
 
 
749 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.01 
 
 
978 aa  303  8e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  27.34 
 
 
755 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  27.34 
 
 
755 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  27.21 
 
 
755 aa  298  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 
755 aa  298  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  27.21 
 
 
755 aa  297  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  27.21 
 
 
755 aa  297  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  26.69 
 
 
755 aa  290  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  26.44 
 
 
755 aa  285  2e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.68 
 
 
1051 aa  284  4e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.94 
 
 
1052 aa  283  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  26.47 
 
 
761 aa  275  2e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.54 
 
 
1053 aa  275  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  26.35 
 
 
761 aa  274  5e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.62 
 
 
1053 aa  274  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  28.99 
 
 
753 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  26.8 
 
 
776 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.38 
 
 
1051 aa  263  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.82 
 
 
1050 aa  259  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.85 
 
 
1055 aa  256  1e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  31.91 
 
 
760 aa  255  2e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.85 
 
 
762 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.63 
 
 
777 aa  251  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.33 
 
 
1314 aa  240  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.87 
 
 
807 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  26.23 
 
 
807 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>