13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1102 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  30.74 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  35.68 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  37.67 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  42.04 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  32.39 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  34.94 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  29 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  30.05 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  28.12 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  32.8 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  31.62 
 
 		 291 aa  52  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>