More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1081 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  100 
 
 		 447 aa  884    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  59.91 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  40.99 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  35.11 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 451 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 451 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  25.5 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  32.23 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  32.58 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  25.68 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 460 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  22.45 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  23.3 
 
 		 466 aa  136  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.92 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.36 
 
 		 451 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.56 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.62 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  24.43 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.38 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 460 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 456 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.67 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 456 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 462 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  24.61 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.3 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  21.2 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 458 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 447 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 462 aa  113  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 454 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  21.68 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 458 aa  109  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  23.22 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  23.96 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  21.28 
 
 		 446 aa  106  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.97 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  20.7 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  23.03 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 445 aa  103  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  22.08 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  23.47 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  23.01 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  22.78 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  23.01 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>