168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1052 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  100 
 
 
444 aa  889    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1833  L-fucose transporter  56.35 
 
 
644 aa  490  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  42.47 
 
 
434 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  39.1 
 
 
430 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  38.55 
 
 
448 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  40.48 
 
 
474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  41.36 
 
 
442 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  41.44 
 
 
381 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  36.67 
 
 
434 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  36.34 
 
 
411 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  31.99 
 
 
443 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  32.35 
 
 
438 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  32.35 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  32.35 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  32.35 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  32.35 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  33.26 
 
 
457 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  32.06 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  32.06 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  32.06 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  32.06 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  32.06 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  32.35 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  33.49 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  33.56 
 
 
457 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  33.56 
 
 
457 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  34.6 
 
 
457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.48 
 
 
417 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  32.73 
 
 
433 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  33.18 
 
 
417 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.16 
 
 
417 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  29.91 
 
 
420 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  32 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  31.97 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  29.86 
 
 
414 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.68 
 
 
431 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  30.77 
 
 
412 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  31.74 
 
 
409 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  28.5 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  29.04 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  30.72 
 
 
448 aa  201  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  28.6 
 
 
436 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  30.41 
 
 
421 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  29.23 
 
 
435 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  31.85 
 
 
451 aa  192  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  28.96 
 
 
413 aa  192  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  28.6 
 
 
424 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  29.23 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  28.89 
 
 
438 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  28.89 
 
 
438 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  28.89 
 
 
438 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  28.89 
 
 
438 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  28.89 
 
 
438 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  27.99 
 
 
435 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  28.51 
 
 
424 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  29.35 
 
 
428 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  29.66 
 
 
423 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  30.33 
 
 
415 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  29.43 
 
 
423 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  29.2 
 
 
431 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  28.77 
 
 
428 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  30.71 
 
 
423 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  28.97 
 
 
431 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  30.48 
 
 
423 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  30.48 
 
 
423 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  30.48 
 
 
423 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  30.48 
 
 
423 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  30.86 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  28.74 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  31.59 
 
 
399 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  28.47 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  29.48 
 
 
420 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  28.67 
 
 
421 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  28.74 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  29.43 
 
 
415 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  30.33 
 
 
427 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.89 
 
 
435 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  27.79 
 
 
410 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  28.79 
 
 
418 aa  177  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  28.53 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  26.98 
 
 
425 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.32 
 
 
429 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  29.51 
 
 
440 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  26.67 
 
 
412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  29.8 
 
 
436 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  29.62 
 
 
425 aa  160  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  27.74 
 
 
426 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
468 aa  156  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  28.57 
 
 
426 aa  156  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.37 
 
 
471 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  26.55 
 
 
428 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  28.54 
 
 
413 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  28.44 
 
 
389 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  29.53 
 
 
412 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  30.45 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  30.02 
 
 
426 aa  146  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.29 
 
 
443 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  29.54 
 
 
403 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  29.43 
 
 
408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  28.94 
 
 
408 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>