More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1051 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 
234 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  49.11 
 
 
264 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  45.49 
 
 
265 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  46.34 
 
 
207 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  43.48 
 
 
216 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  45.54 
 
 
220 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  44.88 
 
 
214 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  45.77 
 
 
214 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  39.91 
 
 
225 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  41.06 
 
 
215 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  42.21 
 
 
235 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 
303 aa  154  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  42.21 
 
 
235 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  42.64 
 
 
235 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  41.79 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  33.18 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  37.91 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  31.19 
 
 
398 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  33.67 
 
 
214 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  32.71 
 
 
215 aa  119  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  31.43 
 
 
271 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.71 
 
 
217 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
222 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
222 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  32.97 
 
 
210 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  34.11 
 
 
215 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  33.33 
 
 
211 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  32.09 
 
 
428 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  33.17 
 
 
212 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  31.79 
 
 
215 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  32.41 
 
 
236 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  31.77 
 
 
427 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 
219 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  34.74 
 
 
192 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  32.86 
 
 
237 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  38.1 
 
 
185 aa  102  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 
216 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  32.24 
 
 
220 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  31.55 
 
 
210 aa  101  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  35.33 
 
 
189 aa  101  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  34.97 
 
 
215 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  31.52 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  31.52 
 
 
231 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  32.07 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  32.07 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  32.07 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  30.95 
 
 
212 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  32.76 
 
 
180 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  32.07 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  32.07 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  32.07 
 
 
212 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  32.07 
 
 
212 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  30.95 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  30.95 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  30.95 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  30.81 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  30.95 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  33.88 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  32.49 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  30.19 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  34.07 
 
 
181 aa  99  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  30.56 
 
 
220 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  32.87 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 
181 aa  98.6  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  32.24 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  30.32 
 
 
180 aa  97.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  28.96 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  35.5 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  31.38 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  31.69 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  33.86 
 
 
188 aa  96.3  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  32.97 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  32.97 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  32.97 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  32.97 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  31.13 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  32.79 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  35.05 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  30.28 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  30.16 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  31.43 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  30.73 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  30.65 
 
 
224 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  29.73 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  30.41 
 
 
190 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  29.58 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  30.43 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  31.55 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  29.73 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  30.48 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  30.43 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1072  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 
189 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  31.49 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  32.11 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  30 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  28.31 
 
 
218 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>