247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1043 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 
163 aa  221  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  51.23 
 
 
167 aa  163  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  37.34 
 
 
157 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  36.71 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  36.77 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  36.77 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  36.77 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  35.44 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  34.84 
 
 
155 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  34.84 
 
 
155 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  35.48 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  29.94 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  31.76 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  29.37 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  27.56 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  24.2 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  25.85 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  30.16 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  35.61 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  34.59 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  26.17 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  29.58 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  31.54 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2511  MutT/Nudix family protein  28.57 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  28.89 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
299 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2810  mutT/nudix family protein  29.92 
 
 
146 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00396019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
156 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 
132 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2545  MutT/Nudix family protein  27.82 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  28.89 
 
 
158 aa  52  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
102 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  34.92 
 
 
131 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  31.54 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  28.24 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  34.81 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  27.64 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  34.13 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  34.71 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  34.13 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  29.77 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  35.45 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  29.01 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  27.2 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.340623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  33.88 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  24.68 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  31.69 
 
 
447 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  32.93 
 
 
205 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
282 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  41.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  41.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  41.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  41.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  41.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  41.27 
 
 
129 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
155 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.09 
 
 
172 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  35.21 
 
 
158 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  41.33 
 
 
147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  34.85 
 
 
530 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  30 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2593  mutT/nudix family protein  27.56 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00926746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2781  mutT/nudix family protein  27.56 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
270 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>