More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1002 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1002  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 408 aa  844    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000070505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  44.33 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1059  amidohydrolase  37.97 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0752616  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  39.39 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.39 
 
 		 403 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  39.23 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.87 
 
 		 390 aa  259  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  35.87 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.63 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  36 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  36.72 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  37.97 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.03 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  34 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  35.55 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.62 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  37.99 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  35.8 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.01 
 
 		 404 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1434  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.71 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  34.31 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  36.43 
 
 		 410 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  35.64 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.58 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  36.9 
 
 		 395 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  34.8 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  37.04 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.63 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  35.34 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  37.07 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  37.87 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  35.41 
 
 		 480 aa  232  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  36.54 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  33.91 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  35.47 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.28 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  33.5 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  35.05 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  35.38 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  32.2 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  36.32 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  34.73 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  33.5 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  33.77 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  36.9 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  33.25 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  34.68 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  33.33 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  35.97 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  35.57 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  35.37 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  33.17 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  35 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  34.23 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  33.42 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  34.88 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  35.38 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  35.35 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.25 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.91 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  34.88 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  32.91 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  35.8 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1139  amidohydrolase  34.72 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  34.26 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  33.17 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  34.02 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  35.03 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  34.9 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  33.74 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  34.52 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  33.08 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  35.29 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  34.29 
 
 		 410 aa  220  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  33.5 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  34.94 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  33.25 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  35.93 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1876  amidohydrolase  35.46 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  33.67 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  33.92 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  34.16 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  33.92 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  34 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  34.68 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  33.92 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  33.08 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  32.99 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  35.14 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  35.14 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  33.08 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  32.3 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  33.42 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  35.46 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  31.67 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  34.41 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  33.16 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  35.46 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>