23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0840 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  100 
 
 		 522 aa  1073    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  97.13 
 
 		 522 aa  1044    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  24.84 
 
 		 766 aa  110  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  27.58 
 
 		 748 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  23.99 
 
 		 914 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  24.38 
 
 		 1011 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  24.17 
 
 		 1065 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  24.33 
 
 		 1157 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  24.32 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  24.82 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  30.04 
 
 		 1224 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  26.45 
 
 		 979 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  23.17 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  24.12 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  23.31 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  23.54 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  22.45 
 
 		 623 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  24.58 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  21.17 
 
 		 904 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  25.43 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  28.69 
 
 		 630 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  23.93 
 
 		 359 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  21.61 
 
 		 624 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>