More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0833 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  100 
 
 		 94 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  97.87 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  56.94 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  50 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  57.89 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  50.75 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  48.65 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  48.65 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  53.73 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 95 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  52.11 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  46.25 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  51.56 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  50.75 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  39.51 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  47.76 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  38.27 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  53.03 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  53.03 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  41.03 
 
 		 306 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>