More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0785 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  100 
 
 
556 aa  1107    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  49.64 
 
 
555 aa  556  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  44.39 
 
 
569 aa  476  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.04 
 
 
555 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  40.61 
 
 
547 aa  448  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  39.53 
 
 
552 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
638 aa  339  8e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  52.22 
 
 
319 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  47 
 
 
409 aa  286  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  44.19 
 
 
304 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  45.11 
 
 
315 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.9 
 
 
427 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  45.63 
 
 
304 aa  269  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.47 
 
 
403 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  45.07 
 
 
317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  45.07 
 
 
317 aa  266  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  47.08 
 
 
308 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
308 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  44.76 
 
 
323 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  45.57 
 
 
340 aa  259  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  44.84 
 
 
312 aa  259  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.41 
 
 
316 aa  257  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  43.27 
 
 
310 aa  257  5e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  45.16 
 
 
308 aa  257  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  42.99 
 
 
318 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.59 
 
 
396 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  44.66 
 
 
306 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.63 
 
 
306 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  44.62 
 
 
318 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  43.99 
 
 
321 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.99 
 
 
321 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.99 
 
 
321 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  43.99 
 
 
318 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  43.99 
 
 
318 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  43.99 
 
 
318 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  43.99 
 
 
318 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  44.3 
 
 
318 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25220  thioredoxin-disulfide reductase  45.22 
 
 
313 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000419952  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  43.99 
 
 
318 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  43.65 
 
 
316 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  41.72 
 
 
310 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  43.18 
 
 
311 aa  246  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  41.77 
 
 
318 aa  246  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  42.17 
 
 
310 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.15 
 
 
406 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  42.26 
 
 
312 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  42.26 
 
 
312 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.38 
 
 
333 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.38 
 
 
333 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.38 
 
 
333 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  40.58 
 
 
304 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  40.63 
 
 
410 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  42.72 
 
 
460 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.55 
 
 
394 aa  239  9e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  43.48 
 
 
317 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  42.48 
 
 
309 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
334 aa  239  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.71 
 
 
331 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  41.1 
 
 
330 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  42.77 
 
 
308 aa  238  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.58 
 
 
407 aa  237  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.12 
 
 
308 aa  237  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
311 aa  237  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  40.06 
 
 
306 aa  237  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  42.9 
 
 
316 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
456 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  41.85 
 
 
311 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  41.48 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  42.36 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  38.37 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.38 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  41.21 
 
 
311 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.07 
 
 
312 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.38 
 
 
359 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.61 
 
 
306 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  41.35 
 
 
325 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.54 
 
 
306 aa  233  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
329 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  39.48 
 
 
310 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
330 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.49 
 
 
326 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.56 
 
 
305 aa  233  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  37.03 
 
 
340 aa  232  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  42.04 
 
 
322 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  36.56 
 
 
353 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  40.95 
 
 
311 aa  230  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
318 aa  231  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  37.35 
 
 
333 aa  230  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
311 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  40.75 
 
 
461 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  40.75 
 
 
461 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
311 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40.32 
 
 
335 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  42.07 
 
 
302 aa  229  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  41.96 
 
 
325 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  38.98 
 
 
348 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
319 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  34.5 
 
 
361 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  46.05 
 
 
306 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  38.06 
 
 
317 aa  228  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>