183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0717 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  100 
 
 		 279 aa  553  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  60.43 
 
 		 271 aa  338  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  57.55 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  57.76 
 
 		 272 aa  324  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  59.57 
 
 		 268 aa  318  7e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  54.05 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  52.38 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  52.03 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  50.55 
 
 		 270 aa  285  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  52.01 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  53.26 
 
 		 266 aa  278  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  52.43 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  49.33 
 
 		 300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  52.45 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  52.35 
 
 		 266 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  51.43 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  51.43 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  47.27 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  49.82 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  42.39 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  41.97 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  41.55 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  44.21 
 
 		 269 aa  188  9e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  43.57 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  39.16 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  44.62 
 
 		 390 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  34.07 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  32.82 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  34.66 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  35.16 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  35.16 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  35.16 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  35.16 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  36.69 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  47.18 
 
 		 188 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  31.1 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  30.6 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  31.5 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  32.39 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  31 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  31.8 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  32.33 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  31.69 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  33.8 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  31.91 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  32.62 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  31.2 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  27.7 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  31.8 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.33 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  31.73 
 
 		 245 aa  99.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  31.73 
 
 		 245 aa  99.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  30.94 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.47 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  31.56 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  31.9 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  27.84 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  27.84 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  29.81 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  29.93 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  32.71 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  31.72 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  30.04 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  29.72 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  30.45 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  28.77 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  28.46 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  40 
 
 		 125 aa  90.1  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  28.11 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  29.2 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.79 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  30.26 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  30.67 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  28.24 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  29.29 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  30.29 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  31.32 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  28.37 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  30.26 
 
 		 312 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  27.86 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  28.14 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  29.67 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  29.52 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  27.59 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  25.65 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  26.79 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  27.5 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  25.74 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  28.06 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>