More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0695 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
144 aa  291  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  97.22 
 
 
146 aa  284  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.78 
 
 
145 aa  198  2e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 
145 aa  178  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.16 
 
 
144 aa  176  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 
142 aa  174  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 
142 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
144 aa  164  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.93441e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
144 aa  164  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
146 aa  162  1e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.94 
 
 
148 aa  162  1e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
146 aa  162  1e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 
153 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 
153 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
147 aa  160  8e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
144 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.27848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
145 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
146 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 
149 aa  157  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
145 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
156 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.15 
 
 
160 aa  157  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
150 aa  156  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.08 
 
 
145 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 
150 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
156 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
148 aa  154  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
151 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
159 aa  154  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
148 aa  153  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
150 aa  153  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.08 
 
 
144 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.75 
 
 
145 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
160 aa  151  3e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
161 aa  151  3e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
159 aa  150  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 
161 aa  150  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
150 aa  151  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 
142 aa  150  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
148 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
145 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
147 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.95076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 
150 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 
145 aa  148  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
145 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.22 
 
 
184 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.07 
 
 
152 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
152 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 
151 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
147 aa  147  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
141 aa  147  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
156 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
156 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 
146 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
150 aa  146  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
163 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 
149 aa  146  1e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.61 
 
 
150 aa  145  1e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
157 aa  145  2e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
145 aa  145  2e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
159 aa  144  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
152 aa  144  4e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  47.62 
 
 
150 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
159 aa  144  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
159 aa  144  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
148 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  7.97805e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
162 aa  143  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
160 aa  143  7e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 
145 aa  143  7e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  49.3 
 
 
146 aa  143  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.74 
 
 
137 aa  143  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.89 
 
 
165 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
149 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
159 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
149 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
151 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  49.24 
 
 
144 aa  140  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 
150 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
154 aa  140  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
156 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
156 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
156 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 
155 aa  140  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  50.35 
 
 
149 aa  140  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
151 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
153 aa  139  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
145 aa  139  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.67198e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.49 
 
 
145 aa  139  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.61 
 
 
149 aa  139  1e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
151 aa  139  1e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
151 aa  139  1e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.60325e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>