More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0684 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  99.07 
 
 
215 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  65.58 
 
 
215 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  67.45 
 
 
216 aa  298  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  65.12 
 
 
215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  65.44 
 
 
217 aa  297  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  64.65 
 
 
215 aa  296  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  63.26 
 
 
215 aa  291  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  67.3 
 
 
214 aa  290  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  62.09 
 
 
213 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  65.4 
 
 
214 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  64.93 
 
 
214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  65.55 
 
 
214 aa  284  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  63.98 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  63.98 
 
 
216 aa  279  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  61.97 
 
 
213 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  60.66 
 
 
213 aa  278  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  59.72 
 
 
213 aa  278  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  64.65 
 
 
215 aa  276  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  66.36 
 
 
217 aa  276  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  63.16 
 
 
214 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  59.53 
 
 
215 aa  275  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  58.14 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  62.56 
 
 
214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  58.02 
 
 
226 aa  272  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  61.79 
 
 
213 aa  271  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  58.02 
 
 
214 aa  271  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  60.19 
 
 
221 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  64.35 
 
 
217 aa  269  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  59.52 
 
 
215 aa  267  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  61.32 
 
 
218 aa  266  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  58.57 
 
 
215 aa  266  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  61.4 
 
 
215 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  58.85 
 
 
216 aa  265  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  58.49 
 
 
216 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  62.56 
 
 
219 aa  264  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  59.26 
 
 
223 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  55.45 
 
 
217 aa  262  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  54.98 
 
 
218 aa  262  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  55.45 
 
 
214 aa  261  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  54.5 
 
 
246 aa  259  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  56.28 
 
 
217 aa  259  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  53.08 
 
 
218 aa  257  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  51.66 
 
 
223 aa  255  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  57.87 
 
 
222 aa  254  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  55.92 
 
 
217 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  54.63 
 
 
217 aa  252  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  55.92 
 
 
217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  55.35 
 
 
219 aa  250  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  55.45 
 
 
217 aa  250  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  50.71 
 
 
214 aa  250  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  55.45 
 
 
215 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1846  putative translaldolase  58.9 
 
 
222 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  53.24 
 
 
217 aa  249  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  57.41 
 
 
222 aa  249  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  52.13 
 
 
221 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  60.75 
 
 
218 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  53.55 
 
 
216 aa  249  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3103  putative translaldolase  58.9 
 
 
222 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  51.66 
 
 
215 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3411  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3409  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3399  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3179  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.319562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3080  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3430  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3386  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.433866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  54.42 
 
 
216 aa  244  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  55.56 
 
 
226 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3163  putative translaldolase  57.99 
 
 
222 aa  244  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  53.49 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  54.42 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  51.63 
 
 
215 aa  242  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  55.09 
 
 
218 aa  242  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  53.24 
 
 
223 aa  242  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  57.28 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2088  putative translaldolase  58.33 
 
 
222 aa  239  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1679  putative translaldolase  52.09 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  52.78 
 
 
221 aa  238  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  53.02 
 
 
220 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  53.81 
 
 
218 aa  237  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  53.49 
 
 
215 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  52.78 
 
 
218 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1454  transaldolase  54.98 
 
 
214 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00117574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  53.95 
 
 
218 aa  235  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  50.93 
 
 
217 aa  234  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  52.61 
 
 
217 aa  234  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  51.6 
 
 
219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  52.63 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  54.17 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  52.29 
 
 
219 aa  231  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  53.02 
 
 
217 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2174  putative transaldolase  59.72 
 
 
215 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>