22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0639 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0627  hypothetical protein  98.7 
 
 		 463 aa  916    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.665154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  927    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0150059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1508  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1780  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111694  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3614  hypothetical protein  27.96 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.746292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4691  hypothetical protein  27.96 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0863049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0200  hypothetical protein  23.79 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0418162  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7091  hypothetical protein  27.27 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0257  hypothetical protein  22.47 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5087  hypothetical protein  22.68 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224053  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0200  hypothetical protein  22.47 
 
 		 549 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0232  hypothetical protein  22.47 
 
 		 549 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0223  hypothetical protein  22.1 
 
 		 549 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0204  hypothetical protein  22.1 
 
 		 549 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000016319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0213  hypothetical protein  22.1 
 
 		 549 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0013611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0239  hypothetical protein  22.1 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.374038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0239  YdaL  22.1 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0211882  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00391  hypothetical protein  26.84 
 
 		 578 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0724219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0380  hypothetical protein  25.56 
 
 		 547 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396423  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2656  hypothetical protein  25.79 
 
 		 546 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352143  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2155  hypothetical protein  25.51 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0522768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2245  hypothetical protein  25.51 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.898988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>