More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0626 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
554 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
562 aa  674    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
554 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
554 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
554 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
556 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 
554 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
567 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 
563 aa  702    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
552 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
570 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
554 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 
556 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  62.43 
 
 
565 aa  710    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 
561 aa  719    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  57.89 
 
 
554 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
569 aa  678    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 
565 aa  638    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 
556 aa  651    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
564 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
554 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
582 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 
609 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
553 aa  653    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
567 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
565 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
559 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 
564 aa  661    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 
555 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
570 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
566 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
552 aa  656    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
572 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
579 aa  641    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
553 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
554 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  60 
 
 
568 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 
568 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 
560 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
555 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 
583 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 
565 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
552 aa  652    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 
555 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
552 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
569 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
555 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
561 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 
567 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
555 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 
559 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 
555 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
554 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
569 aa  646    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
552 aa  652    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 
567 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 
556 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
561 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 
576 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 
558 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
582 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 
558 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
555 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
555 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
556 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
561 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 
565 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
705 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
552 aa  1147    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  98.91 
 
 
552 aa  1139    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
548 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 
580 aa  738    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  73.77 
 
 
540 aa  855    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
587 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 
589 aa  707    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
565 aa  677    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
556 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
554 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 
563 aa  656    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 
564 aa  717    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 
565 aa  724    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
565 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 
557 aa  673    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 
551 aa  631  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
557 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 
556 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 
590 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
556 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
556 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
551 aa  628  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
569 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
569 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
556 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
556 aa  631  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
569 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
569 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>