More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0623 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  100 
 
 
231 aa  457  1e-128  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  97.4 
 
 
231 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  2.82114e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.03 
 
 
232 aa  276  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.39 
 
 
238 aa  272  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  62.95 
 
 
234 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.42772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  53.81 
 
 
239 aa  266  3e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 
236 aa  261  9e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.4965e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 
229 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 
231 aa  253  2e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.9 
 
 
230 aa  252  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 
226 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.76926e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  55.65 
 
 
232 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 
235 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.72 
 
 
230 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
239 aa  243  1e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
239 aa  243  1e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.52217e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.84 
 
 
234 aa  243  2e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  52.97 
 
 
235 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  52.97 
 
 
235 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
232 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 
235 aa  238  6e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 
235 aa  238  6e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  52.36 
 
 
233 aa  238  7e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
231 aa  238  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.48 
 
 
236 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 
227 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.78 
 
 
229 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  52.12 
 
 
235 aa  236  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 
233 aa  235  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  51.28 
 
 
233 aa  235  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  49.78 
 
 
230 aa  235  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.14 
 
 
239 aa  235  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  52.63 
 
 
233 aa  234  6e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.91 
 
 
229 aa  233  1e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  51.5 
 
 
239 aa  233  1e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  49.12 
 
 
226 aa  234  1e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 
239 aa  233  2e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.94698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
226 aa  233  2e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 
234 aa  233  2e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  51.53 
 
 
234 aa  233  2e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  52.1 
 
 
236 aa  233  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  232  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  49.34 
 
 
229 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  50 
 
 
239 aa  232  4e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.20928e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  232  4e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 
234 aa  231  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  52.59 
 
 
235 aa  230  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  46.52 
 
 
234 aa  229  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 
236 aa  229  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 
238 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
235 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.49 
 
 
237 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  53.65 
 
 
235 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 
223 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  47.58 
 
 
223 aa  228  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 
223 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 
231 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 
223 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 
223 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  47.14 
 
 
223 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  51.32 
 
 
235 aa  228  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 
226 aa  227  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
223 aa  227  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 
226 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  51.5 
 
 
236 aa  228  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 
223 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 
230 aa  227  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.42 
 
 
234 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  47.77 
 
 
225 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 
238 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 
223 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 
223 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.81 
 
 
237 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 
229 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 
226 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 
230 aa  225  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.16 
 
 
246 aa  225  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 
226 aa  225  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 
229 aa  225  5e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  46.32 
 
 
256 aa  223  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
236 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 
226 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 
237 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 
230 aa  223  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.49 
 
 
229 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 
228 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>