More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0617 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  100 
 
 		 276 aa  550  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  98.55 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  62.18 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  65.74 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  52.71 
 
 		 272 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  45.1 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  44.01 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  48.55 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  44.78 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  41.79 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  41.79 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  45.38 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  44.65 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  43.57 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  42.74 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  45.27 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  41.79 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  41.84 
 
 		 281 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  40.54 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  41.49 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.82 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  40.07 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  39.86 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  41.95 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  38.79 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  38.91 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  39.11 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  41 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.34 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  37.28 
 
 		 284 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.08 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  40.89 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  39.22 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  38.78 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  35.59 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  37.82 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  37.02 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  36.59 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  33.09 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.21 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  35.69 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  35.64 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  37.4 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  36.63 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  37.26 
 
 		 282 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  37.25 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  39.06 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  36.9 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.98 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  39.86 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  33.84 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  36.55 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  34.83 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  37.3 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  36.36 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  39.33 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  37.66 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  36.57 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  36.92 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  32.06 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  33.68 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  35.44 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  33.45 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  33.82 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  34.54 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  35.25 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  34.87 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  36.25 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.77 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  32.67 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33.99 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  28.84 
 
 		 558 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.52 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  33.59 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2840  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.73 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  35.97 
 
 		 330 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  30.98 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  34.41 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.05 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.94 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  33.87 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  29.71 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1881  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.98 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  33.86 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  32.16 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  31.85 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.2 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.2 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.61 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  33.68 
 
 		 323 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  38.27 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.94 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  29.82 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1882  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.91 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.628761  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.96 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 519 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>