More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0559 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  67.14 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  63.47 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  55.66 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  55.66 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  55.45 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  55.45 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  55.45 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  55.45 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  55.45 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  55.45 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  55.45 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  61.7 
 
 		 194 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  50.25 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  42.94 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  27.88 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  31.82 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  35.44 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  32.11 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  35.17 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.82 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  30.26 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  36.05 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  32.2 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  36.05 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  37.16 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  31.22 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  28.93 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  26.7 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  29.57 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  30.08 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  31.76 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  25.76 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  34.69 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  30.41 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.94 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.96 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  27.6 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  29.32 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  36.5 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.24 
 
 		 623 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.54 
 
 		 705 aa  71.6  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.88 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.75 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.7 
 
 		 738 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  27.57 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  29.35 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.12 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  26.26 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  28.67 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.81 
 
 		 717 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.34 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  30.52 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  31.9 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  31.9 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  28.02 
 
 		 716 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.68 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  31.9 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  30.52 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.3 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.84 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.62 
 
 		 746 aa  65.5  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  29.61 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  29.57 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.61 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  27.22 
 
 		 735 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  28.35 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0982  hypothetical protein  22.51 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  28.02 
 
 		 722 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0963  hypothetical protein  22.51 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.46 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  27.04 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  35.59 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>