62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0550 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  100 
 
 		 330 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  48.19 
 
 		 552 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 651 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  39.86 
 
 		 550 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  40.32 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  43.64 
 
 		 613 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  41.41 
 
 		 602 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  43.51 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  45.96 
 
 		 502 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  45.93 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  47.96 
 
 		 807 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  41.41 
 
 		 891 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  43.89 
 
 		 2495 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  52.15 
 
 		 750 aa  170  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  40.27 
 
 		 532 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  34.94 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  39.41 
 
 		 811 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  34.9 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  47.02 
 
 		 478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  38.12 
 
 		 753 aa  145  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  40 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  39.81 
 
 		 592 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 757 aa  139  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  38.86 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  50.38 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  38.25 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  41.04 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  30.91 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  35.94 
 
 		 817 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  47.93 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  34.39 
 
 		 1557 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  29.58 
 
 		 1131 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  29.58 
 
 		 697 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  29.58 
 
 		 1131 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  30.05 
 
 		 465 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  40.76 
 
 		 1732 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.78 
 
 		 762 aa  92.4  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.84 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  36.17 
 
 		 578 aa  86.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  36.3 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  31.05 
 
 		 2821 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.92 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  35.34 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  29.09 
 
 		 890 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  29.73 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  28.44 
 
 		 1514 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  23.63 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  30.26 
 
 		 1475 aa  62.4  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  29.93 
 
 		 1527 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.31 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  27.12 
 
 		 587 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.5 
 
 		 474 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0390  hypothetical protein  48.39 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  26.11 
 
 		 532 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  23.36 
 
 		 420 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  23.83 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1573  metallo-beta-lactamase family protein  26.83 
 
 		 626 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.89 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1002 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.51 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1009 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  30 
 
 		 519 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>