More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0544 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  100 
 
 		 721 aa  1466    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  52.22 
 
 		 739 aa  764    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  56.36 
 
 		 727 aa  824    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  98.06 
 
 		 728 aa  1451    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  52.15 
 
 		 739 aa  762    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  56.22 
 
 		 727 aa  816    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  37.5 
 
 		 719 aa  482  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 		 723 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  35.72 
 
 		 708 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 		 705 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  35.26 
 
 		 713 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 		 649 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  36.62 
 
 		 734 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  34.35 
 
 		 695 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  34.94 
 
 		 740 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  35.3 
 
 		 708 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  37.03 
 
 		 646 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  38.05 
 
 		 638 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 638 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  35.05 
 
 		 682 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 638 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 638 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.52 
 
 		 704 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.34 
 
 		 711 aa  399  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  36.64 
 
 		 644 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  36.69 
 
 		 638 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 		 649 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  35.64 
 
 		 645 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 		 672 aa  349  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  38.16 
 
 		 553 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  32.44 
 
 		 657 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 657 aa  333  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.56 
 
 		 657 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 653 aa  323  9.000000000000001e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 		 654 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 662 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.69 
 
 		 660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 689 aa  311  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 		 657 aa  308  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 		 631 aa  308  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 582 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 638 aa  301  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 729 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.98 
 
 		 656 aa  297  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 702 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 712 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.82 
 
 		 712 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  30.96 
 
 		 712 aa  280  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 712 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 712 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 712 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 727 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  31.79 
 
 		 712 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.87 
 
 		 712 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 607 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 712 aa  273  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 651 aa  270  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 		 673 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 		 614 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  30.86 
 
 		 716 aa  267  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 680 aa  267  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 		 699 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 712 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 684 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 717 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 		 570 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  31.18 
 
 		 716 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 839 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 		 670 aa  262  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  30.86 
 
 		 699 aa  261  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 		 675 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 692 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 		 730 aa  259  9e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 737 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 		 644 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 655 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 556 aa  259  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 656 aa  258  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 562 aa  256  7e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  30.89 
 
 		 699 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 716 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 716 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 654 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  29.86 
 
 		 699 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 673 aa  253  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.99 
 
 		 622 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.07 
 
 		 716 aa  253  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 716 aa  252  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 578 aa  252  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 670 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>