58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0490 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  100 
 
 		 1557 aa  3110    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  24.55 
 
 		 2821 aa  149  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.82 
 
 		 762 aa  136  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 602 aa  134  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  42.25 
 
 		 502 aa  132  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  32.87 
 
 		 757 aa  129  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  32.33 
 
 		 550 aa  127  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  34.32 
 
 		 811 aa  125  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  41.95 
 
 		 454 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 651 aa  115  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  34.6 
 
 		 330 aa  115  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  36.78 
 
 		 807 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  30.71 
 
 		 613 aa  114  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  34.76 
 
 		 430 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  29.97 
 
 		 331 aa  110  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 324 aa  109  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  37.88 
 
 		 592 aa  108  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  33.12 
 
 		 316 aa  107  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  32.29 
 
 		 750 aa  104  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  27.5 
 
 		 753 aa  103  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 342 aa  102  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  32.33 
 
 		 434 aa  102  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  35.14 
 
 		 478 aa  102  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 532 aa  100  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  33.33 
 
 		 737 aa  99.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  31.27 
 
 		 1475 aa  97.8  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  31.91 
 
 		 552 aa  97.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  27.82 
 
 		 512 aa  96.3  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  27.74 
 
 		 573 aa  94.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  32.75 
 
 		 2495 aa  94.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  28.72 
 
 		 817 aa  93.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  27.72 
 
 		 1514 aa  92.8  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  41.67 
 
 		 302 aa  92.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  28.33 
 
 		 1527 aa  87  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  29.8 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  27.55 
 
 		 890 aa  78.6  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  25.05 
 
 		 1363 aa  78.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.03 
 
 		 891 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  29.88 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  32.33 
 
 		 589 aa  70.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  29 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  30.69 
 
 		 578 aa  67  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  24.84 
 
 		 1131 aa  66.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  24.84 
 
 		 1131 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  24.51 
 
 		 532 aa  65.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  31.94 
 
 		 697 aa  62  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  26.7 
 
 		 1732 aa  58.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  26.39 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.36 
 
 		 350 aa  57.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  33.04 
 
 		 203 aa  57  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  39.66 
 
 		 271 aa  52  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.67 
 
 		 339 aa  48.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  23.69 
 
 		 420 aa  48.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2943  cell wall anchor domain-containing protein  27.92 
 
 		 372 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  29.27 
 
 		 184 aa  45.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3021  cell wall anchor domain-containing protein  27.41 
 
 		 372 aa  45.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00330994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3254  cell wall anchor domain-containing protein  27.41 
 
 		 372 aa  45.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.465207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3006  cell wall anchor domain-containing protein  27.41 
 
 		 372 aa  45.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>