36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0473 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0473  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 356 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000388083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00695  hypothetical protein  25.86 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.1 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  25.71 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.56 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3368  hypothetical protein  21.18 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2854  glycosyltransferase-like protein  17.54 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45289  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.73 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2762  glycosyltransferase-like  17.54 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  21.07 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  24.07 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1364  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  20.58 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2946  glycosyltransferase-like protein  17.92 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  18.49 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0498  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.79 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0148248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  19.13 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.38 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3696  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  38.98 
 
 		 356 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  18.6 
 
 		 768 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>