242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0472 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  100 
 
 		 459 aa  902    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.41 
 
 		 464 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.26 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.21 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  27.76 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  27.23 
 
 		 416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  25.37 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.93 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  28.95 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.66 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.68 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  22.97 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  20.37 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  24.2 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.4 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  21.54 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  23.08 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  21.95 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.51 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.52 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  23.11 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  19.24 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  19.36 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.06 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  21.67 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  23.75 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.57 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  19.71 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  23.5 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  21.24 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  20.26 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  22.52 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  21.93 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  23.26 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  21.62 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  20.58 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  20.88 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  23.19 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  21.3 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  23.47 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.19 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  20.92 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  23.05 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  20.25 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1422  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.54 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.132249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  20.53 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  20.31 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  21.01 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  22.54 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  18.76 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  21.17 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  17.52 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  21.7 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  20.32 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  19.72 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  21.45 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  20.45 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  18.64 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.91 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  22.96 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  20.41 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  22.12 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  22.38 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  22.38 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  20.45 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  20.34 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  22.38 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  20.99 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  22.38 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  21.63 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  22.56 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.45 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  26.72 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  23.62 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  22.25 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  22.56 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  32.63 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  18.18 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  19.81 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  19.57 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  22.61 
 
 		 437 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  21.19 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  21.51 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  21.51 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  20.81 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  22.06 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  21.1 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  19.15 
 
 		 446 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  22.22 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  20.76 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  19.14 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.17 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  20.76 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  20.17 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  20.45 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2425  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase (AlkK-1)  28.77 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  22.16 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>