82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0462 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  94.49 
 
 		 345 aa  634    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0446  hypothetical protein  31.85 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0398916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0456  hypothetical protein  30.72 
 
 		 606 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000703218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  24.37 
 
 		 640 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  24.88 
 
 		 620 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1877  hypothetical protein  32.41 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.044001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  24.34 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  30.16 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.1 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.16 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  24.4 
 
 		 725 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  30.47 
 
 		 717 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  30.47 
 
 		 717 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  30.47 
 
 		 717 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  30.47 
 
 		 717 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  29.25 
 
 		 731 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  28.12 
 
 		 720 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  30.47 
 
 		 717 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  28.12 
 
 		 720 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  28.12 
 
 		 720 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  28.12 
 
 		 717 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  28.12 
 
 		 720 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  28.12 
 
 		 717 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  28.12 
 
 		 720 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  28.12 
 
 		 720 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  28.12 
 
 		 720 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.88 
 
 		 730 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  28.75 
 
 		 711 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.67 
 
 		 740 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  37.5 
 
 		 790 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  26.79 
 
 		 717 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  28.89 
 
 		 655 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.21 
 
 		 763 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.58 
 
 		 763 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.58 
 
 		 763 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  25.58 
 
 		 717 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.58 
 
 		 763 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  31.58 
 
 		 758 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  26.63 
 
 		 711 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  34.78 
 
 		 883 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  27.97 
 
 		 721 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.33 
 
 		 851 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  34.62 
 
 		 695 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  30.53 
 
 		 758 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  30.53 
 
 		 758 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  30.53 
 
 		 758 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.17 
 
 		 724 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  29.17 
 
 		 758 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  29.17 
 
 		 758 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  26.56 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  29.17 
 
 		 758 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  25.62 
 
 		 711 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  29.17 
 
 		 758 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  33.33 
 
 		 764 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  23.39 
 
 		 644 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  33.33 
 
 		 764 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  26.25 
 
 		 721 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  33.33 
 
 		 695 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 695 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.33 
 
 		 695 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.33 
 
 		 695 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.33 
 
 		 764 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  38.33 
 
 		 806 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  29.11 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  24.59 
 
 		 649 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  29.11 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.18 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  26.49 
 
 		 712 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  30.14 
 
 		 727 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  26.49 
 
 		 712 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  26.49 
 
 		 712 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.09 
 
 		 670 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.83 
 
 		 727 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  38.1 
 
 		 708 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.19 
 
 		 725 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  35.82 
 
 		 770 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  26.05 
 
 		 217 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  28.57 
 
 		 740 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  22.6 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  26.55 
 
 		 659 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>