More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0421 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  56.76 
 
 		 551 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  67.15 
 
 		 554 aa  795    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  67.09 
 
 		 554 aa  793    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  67.33 
 
 		 554 aa  796    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  67.33 
 
 		 554 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  66.79 
 
 		 554 aa  789    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  54.61 
 
 		 556 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  67.51 
 
 		 554 aa  800    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  59.1 
 
 		 549 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  67.33 
 
 		 554 aa  796    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  54.08 
 
 		 572 aa  673    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  66.25 
 
 		 554 aa  791    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  67.15 
 
 		 554 aa  791    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  66.79 
 
 		 554 aa  787    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  67.33 
 
 		 554 aa  796    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  55.72 
 
 		 554 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  100 
 
 		 554 aa  1135    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  98.19 
 
 		 554 aa  1116    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  67.09 
 
 		 554 aa  791    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  59.1 
 
 		 549 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  59.06 
 
 		 568 aa  708    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  63.88 
 
 		 555 aa  774    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  54.82 
 
 		 559 aa  628  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  53.21 
 
 		 562 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  53.93 
 
 		 558 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  53.93 
 
 		 558 aa  611  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  51.95 
 
 		 562 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  53.57 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  53.57 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  53.75 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  53.75 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  53.75 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  53.39 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  53.57 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  53.57 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  52.23 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  48.04 
 
 		 563 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  44.72 
 
 		 570 aa  531  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.5 
 
 		 556 aa  532  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.61 
 
 		 560 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.35 
 
 		 563 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  47.02 
 
 		 582 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  43.61 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  45.1 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  46.59 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  46.03 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  45.74 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  46.13 
 
 		 566 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.17 
 
 		 563 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  48.08 
 
 		 536 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.59 
 
 		 538 aa  504  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  41.82 
 
 		 622 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  43.01 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.65 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.67 
 
 		 560 aa  501  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  43.75 
 
 		 600 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.76 
 
 		 562 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  44.21 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.03 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  44.25 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  43.77 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.7 
 
 		 561 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  44.62 
 
 		 561 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  43.53 
 
 		 604 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.06 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  44.34 
 
 		 552 aa  479  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  41.11 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.19 
 
 		 560 aa  475  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  41.36 
 
 		 606 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.68 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  40.42 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  44.39 
 
 		 554 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  42.28 
 
 		 643 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  41.35 
 
 		 596 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1848  alpha-glucosidase  44.53 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.98 
 
 		 551 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.29 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.88 
 
 		 553 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.01 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  43.85 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62666  alpha-glucosidase maltase  44.83 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.97685  normal  0.170022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.47 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.47 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.65 
 
 		 551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.35 
 
 		 553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.65 
 
 		 551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  40.47 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  40.47 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  42.14 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  42.17 
 
 		 553 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.89 
 
 		 554 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29292  alpha-D-glucosidase (maltase) ( alpha-amylase) (MALT) (MAZS)  42.41 
 
 		 573 aa  443  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.47 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.99 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>