250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0393 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  97.88 
 
 
283 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  40.14 
 
 
314 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1072  hypothetical protein  41.24 
 
 
293 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1282  hypothetical protein  41.61 
 
 
285 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1067  hypothetical protein  41.61 
 
 
333 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1322  hypothetical protein  41.61 
 
 
285 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1062  hypothetical protein  41.61 
 
 
333 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1245  hypothetical protein  41.61 
 
 
285 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1085  hypothetical protein  41.24 
 
 
333 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1171  hypothetical protein  41.24 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  40.65 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  219  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1217  hypothetical protein  42.7 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4124  hypothetical protein  42.34 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  37.59 
 
 
309 aa  209  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  36.65 
 
 
288 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0641  hypothetical protein  38.95 
 
 
325 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  31.47 
 
 
292 aa  186  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  36.75 
 
 
297 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  36.4 
 
 
297 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  35.69 
 
 
297 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  35.69 
 
 
297 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  36.04 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  36.92 
 
 
296 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1367  hypothetical protein  28.98 
 
 
288 aa  149  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  35.36 
 
 
285 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3325  hypothetical protein  38.58 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0799721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2305  hypothetical protein  40 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  31.39 
 
 
292 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3668  hypothetical protein  38.82 
 
 
269 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3430  hypothetical protein  38.82 
 
 
269 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3391  hypothetical protein  38.82 
 
 
269 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3700  hypothetical protein  38.82 
 
 
269 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.892499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  35 
 
 
285 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3650  hypothetical protein  38.82 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3342  hypothetical protein  38.43 
 
 
269 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3672  hypothetical protein  38.43 
 
 
269 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.238142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  32.74 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0914  protein of unknown function DUF161  33.59 
 
 
284 aa  132  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  32.58 
 
 
283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3747  hypothetical protein  36.9 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.960722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1570  hypothetical protein  36.9 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  normal  0.530375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  30.4 
 
 
289 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  33.97 
 
 
281 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  30.34 
 
 
287 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  31.71 
 
 
304 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  29.76 
 
 
299 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  34.66 
 
 
288 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  33.58 
 
 
286 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  32.97 
 
 
286 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  31.11 
 
 
311 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  29.69 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  29.69 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3010  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0879703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  30.27 
 
 
295 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  29.69 
 
 
293 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  29.69 
 
 
293 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  32.74 
 
 
287 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  31.42 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  29.96 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  29.3 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  29.3 
 
 
293 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  29.3 
 
 
293 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  29.3 
 
 
293 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  29.3 
 
 
293 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  29.97 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  28.91 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  32.97 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  28.52 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  30.21 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  29.17 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1588  Protein of unknown function DUF2179  33.97 
 
 
289 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  0.342251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  28.52 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  32.63 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  31.45 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  31.45 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  34.33 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  31.1 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  31.1 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  31.1 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  31.1 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  31.1 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  31.1 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  31.71 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  30.66 
 
 
278 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  29.41 
 
 
280 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4135  hypothetical protein  33.11 
 
 
292 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0943435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4032  hypothetical protein  32.78 
 
 
292 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00528347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4416  hypothetical protein  32.78 
 
 
292 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4362  hypothetical protein  32.78 
 
 
292 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0124376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4184  hypothetical protein  32.78 
 
 
292 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4304  YqfU  32.78 
 
 
292 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75009e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4022  hypothetical protein  32.78 
 
 
292 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000230064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>