36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0315 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0309  hypothetical protein  99.11 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0105  hypothetical protein  33.47 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0101  hypothetical protein  31.45 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000075579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5480  hypothetical protein  27.86 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5394  hypothetical protein  28.12 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58278e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5153  hypothetical protein  28.12 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000141896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5545  hypothetical protein  28.12 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000433429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4985  hypothetical protein  27.73 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0146407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5003  group-specific protein  28.52 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5428  hypothetical protein  27.69 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5424  group-specific protein  29.62 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00185358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5526  group-specific protein  28.85 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173284  hitchhiker  0.0000000104917 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0102  hypothetical protein  27.97 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  28.33 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5101  hypothetical protein  31.13 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  27.51 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  28.77 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0213  hypothetical protein  36.11 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  28.5 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  27.57 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3823  hypothetical protein  27.1 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0026  integral membrane protein  25.2 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.667689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4213  integral membrane protein  42.65 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.395001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  41.18 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  34.41 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  34.41 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  34.41 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  34.41 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  34.41 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5423  integral membrane protein  27.6 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23050  predicted integral membrane protein  34.25 
 
 		 315 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0160  hypothetical protein  32.35 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2008  hypothetical protein  32.94 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000169588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5478  hypothetical protein  58.82 
 
 		 55 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>